Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RTP3Q9BQQ7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTP3Q9BQQ7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RTP3Q9BQQ7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTP3Q9BQQ7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTP3Q9BQQ7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTP3Q9BQQ7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTP3Q9BQQ7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RTP3Q9BQQ7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTP3Q9BQQ7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTP3Q9BQQ7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTP3Q9BQQ7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTP3Q9BQQ7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTP3Q9BQQ7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTP3Q9BQQ7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTP3Q9BQQ7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTP3Q9BQQ7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTP3Q9BQQ7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTP3Q9BQQ7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTP3Q9BQQ7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RTP3Q9BQQ7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTP3Q9BQQ7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTP3Q9BQQ7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTP3Q9BQQ7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTP3Q9BQQ7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTP3Q9BQQ7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RTP3Q9BQQ7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTP3Q9BQQ7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTP3Q9BQQ7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTP3Q9BQQ7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTP3Q9BQQ7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTP3Q9BQQ7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTP3Q9BQQ7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTP3Q9BQQ7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTP3Q9BQQ7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTP3Q9BQQ7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTP3Q9BQQ7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTP3Q9BQQ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTP3Q9BQQ7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTP3Q9BQQ7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RTP3Q9BQQ7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTP3Q9BQQ7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTP3Q9BQQ7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTP3Q9BQQ7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTP3Q9BQQ7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTP3Q9BQQ7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTP3Q9BQQ7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RTP3Q9BQQ7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTP3Q9BQQ7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTP3Q9BQQ7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTP3Q9BQQ7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTP3Q9BQQ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTP3Q9BQQ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTP3Q9BQQ7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTP3Q9BQQ7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTP3Q9BQQ7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTP3Q9BQQ7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTP3Q9BQQ7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RTP3Q9BQQ7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RTP3Q9BQQ7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTP3Q9BQQ7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTP3Q9BQQ7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTP3Q9BQQ7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTP3Q9BQQ7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTP3Q9BQQ7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTP3Q9BQQ7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTP3Q9BQQ7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTP3Q9BQQ7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTP3Q9BQQ7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTP3Q9BQQ7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTP3Q9BQQ7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTP3Q9BQQ7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RTP3Q9BQQ7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTP3Q9BQQ7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTP3Q9BQQ7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms