Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SGIP1Q9BQI5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SGIP1Q9BQI5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SGIP1Q9BQI5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SGIP1Q9BQI5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SGIP1Q9BQI5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SGIP1Q9BQI5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SGIP1Q9BQI5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SGIP1Q9BQI5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SGIP1Q9BQI5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SGIP1Q9BQI5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SGIP1Q9BQI5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SGIP1Q9BQI5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SGIP1Q9BQI5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SGIP1Q9BQI5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SGIP1Q9BQI5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SGIP1Q9BQI5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SGIP1Q9BQI5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
SGIP1Q9BQI5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SGIP1Q9BQI5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SGIP1Q9BQI5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SGIP1Q9BQI5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SGIP1Q9BQI5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SGIP1Q9BQI5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SGIP1Q9BQI5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SGIP1Q9BQI5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SGIP1Q9BQI5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SGIP1Q9BQI5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SGIP1Q9BQI5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SGIP1Q9BQI5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SGIP1Q9BQI5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SGIP1Q9BQI5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SGIP1Q9BQI5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SGIP1Q9BQI5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SGIP1Q9BQI5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SGIP1Q9BQI5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SGIP1Q9BQI5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SGIP1Q9BQI5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SGIP1Q9BQI5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SGIP1Q9BQI5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SGIP1Q9BQI5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
SGIP1Q9BQI5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SGIP1Q9BQI5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SGIP1Q9BQI5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SGIP1Q9BQI5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SGIP1Q9BQI5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SGIP1Q9BQI5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SGIP1Q9BQI5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SGIP1Q9BQI5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SGIP1Q9BQI5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SGIP1Q9BQI5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SGIP1Q9BQI5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SGIP1Q9BQI5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
SGIP1Q9BQI5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SGIP1Q9BQI5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SGIP1Q9BQI5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SGIP1Q9BQI5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SGIP1Q9BQI5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SGIP1Q9BQI5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SGIP1Q9BQI5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SGIP1Q9BQI5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SGIP1Q9BQI5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SGIP1Q9BQI5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SGIP1Q9BQI5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SGIP1Q9BQI5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SGIP1Q9BQI5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SGIP1Q9BQI5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
SGIP1Q9BQI5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SGIP1Q9BQI5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SGIP1Q9BQI5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SGIP1Q9BQI5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SGIP1Q9BQI5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SGIP1Q9BQI5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SGIP1Q9BQI5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SGIP1Q9BQI5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SGIP1Q9BQI5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SGIP1Q9BQI5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SGIP1Q9BQI5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SGIP1Q9BQI5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SGIP1Q9BQI5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SGIP1Q9BQI5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SGIP1Q9BQI5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SGIP1Q9BQI5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SGIP1Q9BQI5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SGIP1Q9BQI5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SGIP1Q9BQI5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SGIP1Q9BQI5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SGIP1Q9BQI5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SGIP1Q9BQI5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SGIP1Q9BQI5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SGIP1Q9BQI5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SGIP1Q9BQI5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SGIP1Q9BQI5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SGIP1Q9BQI5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SGIP1Q9BQI5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SGIP1Q9BQI5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SGIP1Q9BQI5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SGIP1Q9BQI5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms