Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM7Q9BQ49 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM7Q9BQ49 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM7Q9BQ49 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM7Q9BQ49 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM7Q9BQ49 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM7Q9BQ49 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM7Q9BQ49 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM7Q9BQ49 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM7Q9BQ49 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM7Q9BQ49 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM7Q9BQ49 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM7Q9BQ49 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM7Q9BQ49 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM7Q9BQ49 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM7Q9BQ49 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM7Q9BQ49 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM7Q9BQ49 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM7Q9BQ49 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM7Q9BQ49 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM7Q9BQ49 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMIM7Q9BQ49 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMIM7Q9BQ49 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMIM7Q9BQ49 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SMIM7Q9BQ49 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMIM7Q9BQ49 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMIM7Q9BQ49 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM7Q9BQ49 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM7Q9BQ49 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMIM7Q9BQ49 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM7Q9BQ49 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM7Q9BQ49 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM7Q9BQ49 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM7Q9BQ49 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM7Q9BQ49 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM7Q9BQ49 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM7Q9BQ49 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM7Q9BQ49 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMIM7Q9BQ49 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMIM7Q9BQ49 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM7Q9BQ49 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM7Q9BQ49 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM7Q9BQ49 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM7Q9BQ49 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM7Q9BQ49 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM7Q9BQ49 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM7Q9BQ49 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM7Q9BQ49 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM7Q9BQ49 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM7Q9BQ49 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM7Q9BQ49 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM7Q9BQ49 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM7Q9BQ49 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM7Q9BQ49 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM7Q9BQ49 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM7Q9BQ49 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM7Q9BQ49 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM7Q9BQ49 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMIM7Q9BQ49 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM7Q9BQ49 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM7Q9BQ49 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMIM7Q9BQ49 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMIM7Q9BQ49 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM7Q9BQ49 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM7Q9BQ49 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM7Q9BQ49 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM7Q9BQ49 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM7Q9BQ49 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM7Q9BQ49 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM7Q9BQ49 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM7Q9BQ49 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM7Q9BQ49 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM7Q9BQ49 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM7Q9BQ49 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms