Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GDF15Q99988 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GDF15Q99988 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GDF15Q99988 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GDF15Q99988 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GDF15Q99988 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GDF15Q99988 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GDF15Q99988 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GDF15Q99988 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GDF15Q99988 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GDF15Q99988 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GDF15Q99988 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GDF15Q99988 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GDF15Q99988 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GDF15Q99988 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GDF15Q99988 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GDF15Q99988 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GDF15Q99988 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GDF15Q99988 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GDF15Q99988 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GDF15Q99988 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GDF15Q99988 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GDF15Q99988 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GDF15Q99988 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GDF15Q99988 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GDF15Q99988 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GDF15Q99988 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GDF15Q99988 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GDF15Q99988 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GDF15Q99988 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GDF15Q99988 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GDF15Q99988 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
GDF15Q99988 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GDF15Q99988 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GDF15Q99988 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GDF15Q99988 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GDF15Q99988 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GDF15Q99988 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GDF15Q99988 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
GDF15Q99988 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GDF15Q99988 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GDF15Q99988 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GDF15Q99988 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GDF15Q99988 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GDF15Q99988 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GDF15Q99988 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GDF15Q99988 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GDF15Q99988 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GDF15Q99988 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GDF15Q99988 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GDF15Q99988 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GDF15Q99988 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GDF15Q99988 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GDF15Q99988 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GDF15Q99988 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GDF15Q99988 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GDF15Q99988 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GDF15Q99988 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GDF15Q99988 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GDF15Q99988 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GDF15Q99988 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GDF15Q99988 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GDF15Q99988 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GDF15Q99988 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GDF15Q99988 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GDF15Q99988 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GDF15Q99988 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GDF15Q99988 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GDF15Q99988 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GDF15Q99988 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GDF15Q99988 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GDF15Q99988 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GDF15Q99988 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GDF15Q99988 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GDF15Q99988 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GDF15Q99988 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GDF15Q99988 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GDF15Q99988 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GDF15Q99988 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GDF15Q99988 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GDF15Q99988 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GDF15Q99988 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GDF15Q99988 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
GDF15Q99988 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GDF15Q99988 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GDF15Q99988 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
GDF15Q99988 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GDF15Q99988 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GDF15Q99988 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GDF15Q99988 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GDF15Q99988 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GDF15Q99988 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GDF15Q99988 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GDF15Q99988 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GDF15Q99988 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GDF15Q99988 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GDF15Q99988 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GDF15Q99988 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
GDF15Q99988 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GDF15Q99988 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229 ms