Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA3CQ99985 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA3CQ99985 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA3CQ99985 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA3CQ99985 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA3CQ99985 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA3CQ99985 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA3CQ99985 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA3CQ99985 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEMA3CQ99985 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEMA3CQ99985 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEMA3CQ99985 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA3CQ99985 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA3CQ99985 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA3CQ99985 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA3CQ99985 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3CQ99985 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3CQ99985 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3CQ99985 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3CQ99985 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3CQ99985 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA3CQ99985 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA3CQ99985 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA3CQ99985 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA3CQ99985 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA3CQ99985 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA3CQ99985 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3CQ99985 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3CQ99985 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3CQ99985 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3CQ99985 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3CQ99985 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3CQ99985 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA3CQ99985 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA3CQ99985 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SEMA3CQ99985 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3CQ99985 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3CQ99985 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3CQ99985 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3CQ99985 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3CQ99985 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3CQ99985 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3CQ99985 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3CQ99985 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3CQ99985 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3CQ99985 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3CQ99985 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3CQ99985 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3CQ99985 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3CQ99985 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3CQ99985 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3CQ99985 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3CQ99985 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3CQ99985 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA3CQ99985 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA3CQ99985 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA3CQ99985 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA3CQ99985 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA3CQ99985 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA3CQ99985 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA3CQ99985 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3CQ99985 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3CQ99985 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3CQ99985 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3CQ99985 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3CQ99985 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3CQ99985 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3CQ99985 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3CQ99985 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3CQ99985 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3CQ99985 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3CQ99985 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3CQ99985 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3CQ99985 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3CQ99985 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA3CQ99985 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms