Protein–RNA interactions for Protein: Q99853

FOXB1, Forkhead box protein B1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXB1Q99853 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXB1Q99853 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXB1Q99853 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXB1Q99853 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXB1Q99853 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXB1Q99853 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXB1Q99853 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXB1Q99853 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXB1Q99853 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXB1Q99853 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXB1Q99853 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXB1Q99853 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXB1Q99853 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXB1Q99853 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXB1Q99853 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXB1Q99853 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXB1Q99853 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXB1Q99853 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXB1Q99853 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXB1Q99853 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXB1Q99853 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXB1Q99853 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXB1Q99853 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXB1Q99853 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXB1Q99853 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXB1Q99853 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXB1Q99853 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXB1Q99853 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXB1Q99853 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXB1Q99853 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXB1Q99853 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXB1Q99853 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXB1Q99853 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXB1Q99853 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXB1Q99853 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXB1Q99853 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXB1Q99853 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXB1Q99853 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXB1Q99853 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXB1Q99853 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXB1Q99853 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXB1Q99853 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXB1Q99853 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXB1Q99853 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXB1Q99853 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXB1Q99853 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXB1Q99853 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXB1Q99853 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXB1Q99853 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms