Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PIK3R4Q99570 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PIK3R4Q99570 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PIK3R4Q99570 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PIK3R4Q99570 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PIK3R4Q99570 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PIK3R4Q99570 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PIK3R4Q99570 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PIK3R4Q99570 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PIK3R4Q99570 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
PIK3R4Q99570 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PIK3R4Q99570 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
PIK3R4Q99570 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PIK3R4Q99570 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PIK3R4Q99570 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PIK3R4Q99570 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PIK3R4Q99570 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PIK3R4Q99570 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PIK3R4Q99570 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PIK3R4Q99570 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PIK3R4Q99570 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PIK3R4Q99570 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PIK3R4Q99570 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PIK3R4Q99570 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PIK3R4Q99570 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PIK3R4Q99570 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PIK3R4Q99570 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
PIK3R4Q99570 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PIK3R4Q99570 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PIK3R4Q99570 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PIK3R4Q99570 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PIK3R4Q99570 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PIK3R4Q99570 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PIK3R4Q99570 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PIK3R4Q99570 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PIK3R4Q99570 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PIK3R4Q99570 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PIK3R4Q99570 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PIK3R4Q99570 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PIK3R4Q99570 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PIK3R4Q99570 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PIK3R4Q99570 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PIK3R4Q99570 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PIK3R4Q99570 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PIK3R4Q99570 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PIK3R4Q99570 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PIK3R4Q99570 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PIK3R4Q99570 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PIK3R4Q99570 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PIK3R4Q99570 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PIK3R4Q99570 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PIK3R4Q99570 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PIK3R4Q99570 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PIK3R4Q99570 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
PIK3R4Q99570 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
PIK3R4Q99570 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.6
PIK3R4Q99570 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PIK3R4Q99570 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PIK3R4Q99570 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PIK3R4Q99570 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PIK3R4Q99570 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PIK3R4Q99570 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PIK3R4Q99570 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PIK3R4Q99570 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PIK3R4Q99570 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PIK3R4Q99570 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PIK3R4Q99570 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PIK3R4Q99570 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PIK3R4Q99570 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PIK3R4Q99570 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PIK3R4Q99570 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PIK3R4Q99570 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PIK3R4Q99570 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PIK3R4Q99570 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PIK3R4Q99570 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PIK3R4Q99570 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
PIK3R4Q99570 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PIK3R4Q99570 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PIK3R4Q99570 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PIK3R4Q99570 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PIK3R4Q99570 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
PIK3R4Q99570 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PIK3R4Q99570 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PIK3R4Q99570 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PIK3R4Q99570 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PIK3R4Q99570 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PIK3R4Q99570 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PIK3R4Q99570 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PIK3R4Q99570 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PIK3R4Q99570 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PIK3R4Q99570 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PIK3R4Q99570 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PIK3R4Q99570 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PIK3R4Q99570 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PIK3R4Q99570 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PIK3R4Q99570 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PIK3R4Q99570 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PIK3R4Q99570 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PIK3R4Q99570 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
PIK3R4Q99570 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms