Protein–RNA interactions for Protein: Q96T83

SLC9A7, Sodium/hydrogen exchanger 7, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A7Q96T83 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC9A7Q96T83 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC9A7Q96T83 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC9A7Q96T83 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC9A7Q96T83 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC9A7Q96T83 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC9A7Q96T83 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC9A7Q96T83 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC9A7Q96T83 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC9A7Q96T83 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC9A7Q96T83 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC9A7Q96T83 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC9A7Q96T83 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC9A7Q96T83 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC9A7Q96T83 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC9A7Q96T83 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC9A7Q96T83 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC9A7Q96T83 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC9A7Q96T83 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC9A7Q96T83 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC9A7Q96T83 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC9A7Q96T83 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC9A7Q96T83 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC9A7Q96T83 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC9A7Q96T83 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC9A7Q96T83 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC9A7Q96T83 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC9A7Q96T83 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC9A7Q96T83 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC9A7Q96T83 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC9A7Q96T83 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC9A7Q96T83 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC9A7Q96T83 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC9A7Q96T83 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC9A7Q96T83 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC9A7Q96T83 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC9A7Q96T83 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC9A7Q96T83 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC9A7Q96T83 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC9A7Q96T83 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC9A7Q96T83 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC9A7Q96T83 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC9A7Q96T83 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC9A7Q96T83 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC9A7Q96T83 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC9A7Q96T83 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC9A7Q96T83 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC9A7Q96T83 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC9A7Q96T83 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC9A7Q96T83 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC9A7Q96T83 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC9A7Q96T83 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC9A7Q96T83 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC9A7Q96T83 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC9A7Q96T83 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC9A7Q96T83 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC9A7Q96T83 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC9A7Q96T83 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC9A7Q96T83 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC9A7Q96T83 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC9A7Q96T83 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC9A7Q96T83 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC9A7Q96T83 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC9A7Q96T83 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC9A7Q96T83 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC9A7Q96T83 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC9A7Q96T83 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC9A7Q96T83 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC9A7Q96T83 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC9A7Q96T83 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC9A7Q96T83 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC9A7Q96T83 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC9A7Q96T83 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC9A7Q96T83 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC9A7Q96T83 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC9A7Q96T83 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC9A7Q96T83 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC9A7Q96T83 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC9A7Q96T83 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC9A7Q96T83 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC9A7Q96T83 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC9A7Q96T83 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC9A7Q96T83 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC9A7Q96T83 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC9A7Q96T83 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC9A7Q96T83 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC9A7Q96T83 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC9A7Q96T83 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC9A7Q96T83 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC9A7Q96T83 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC9A7Q96T83 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC9A7Q96T83 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC9A7Q96T83 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC9A7Q96T83 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC9A7Q96T83 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC9A7Q96T83 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC9A7Q96T83 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC9A7Q96T83 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC9A7Q96T83 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC9A7Q96T83 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms