Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPS6KC1Q96S38 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPS6KC1Q96S38 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPS6KC1Q96S38 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPS6KC1Q96S38 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPS6KC1Q96S38 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPS6KC1Q96S38 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPS6KC1Q96S38 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPS6KC1Q96S38 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPS6KC1Q96S38 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RPS6KC1Q96S38 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPS6KC1Q96S38 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RPS6KC1Q96S38 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPS6KC1Q96S38 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPS6KC1Q96S38 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPS6KC1Q96S38 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPS6KC1Q96S38 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPS6KC1Q96S38 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RPS6KC1Q96S38 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPS6KC1Q96S38 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPS6KC1Q96S38 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPS6KC1Q96S38 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPS6KC1Q96S38 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPS6KC1Q96S38 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPS6KC1Q96S38 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPS6KC1Q96S38 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPS6KC1Q96S38 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPS6KC1Q96S38 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPS6KC1Q96S38 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPS6KC1Q96S38 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPS6KC1Q96S38 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPS6KC1Q96S38 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPS6KC1Q96S38 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPS6KC1Q96S38 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPS6KC1Q96S38 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPS6KC1Q96S38 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS6KC1Q96S38 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS6KC1Q96S38 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS6KC1Q96S38 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS6KC1Q96S38 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6KC1Q96S38 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6KC1Q96S38 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6KC1Q96S38 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6KC1Q96S38 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPS6KC1Q96S38 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPS6KC1Q96S38 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KC1Q96S38 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KC1Q96S38 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KC1Q96S38 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPS6KC1Q96S38 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPS6KC1Q96S38 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPS6KC1Q96S38 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPS6KC1Q96S38 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS6KC1Q96S38 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS6KC1Q96S38 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPS6KC1Q96S38 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPS6KC1Q96S38 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPS6KC1Q96S38 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPS6KC1Q96S38 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KC1Q96S38 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KC1Q96S38 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPS6KC1Q96S38 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPS6KC1Q96S38 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6KC1Q96S38 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6KC1Q96S38 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6KC1Q96S38 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6KC1Q96S38 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6KC1Q96S38 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPS6KC1Q96S38 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPS6KC1Q96S38 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPS6KC1Q96S38 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPS6KC1Q96S38 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPS6KC1Q96S38 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPS6KC1Q96S38 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.9 ms