Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT7

TUBGCP6, Gamma-tubulin complex component 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP6Q96RT7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TUBGCP6Q96RT7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TUBGCP6Q96RT7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TUBGCP6Q96RT7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TUBGCP6Q96RT7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TUBGCP6Q96RT7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TUBGCP6Q96RT7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TUBGCP6Q96RT7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TUBGCP6Q96RT7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TUBGCP6Q96RT7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TUBGCP6Q96RT7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
TUBGCP6Q96RT7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
TUBGCP6Q96RT7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
TUBGCP6Q96RT7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
TUBGCP6Q96RT7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
TUBGCP6Q96RT7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
TUBGCP6Q96RT7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
TUBGCP6Q96RT7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
TUBGCP6Q96RT7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
TUBGCP6Q96RT7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TUBGCP6Q96RT7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TUBGCP6Q96RT7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TUBGCP6Q96RT7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TUBGCP6Q96RT7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TUBGCP6Q96RT7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TUBGCP6Q96RT7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TUBGCP6Q96RT7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TUBGCP6Q96RT7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TUBGCP6Q96RT7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TUBGCP6Q96RT7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TUBGCP6Q96RT7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TUBGCP6Q96RT7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TUBGCP6Q96RT7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TUBGCP6Q96RT7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TUBGCP6Q96RT7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TUBGCP6Q96RT7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TUBGCP6Q96RT7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TUBGCP6Q96RT7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TUBGCP6Q96RT7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TUBGCP6Q96RT7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TUBGCP6Q96RT7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TUBGCP6Q96RT7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TUBGCP6Q96RT7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TUBGCP6Q96RT7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TUBGCP6Q96RT7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TUBGCP6Q96RT7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TUBGCP6Q96RT7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TUBGCP6Q96RT7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TUBGCP6Q96RT7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TUBGCP6Q96RT7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TUBGCP6Q96RT7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TUBGCP6Q96RT7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TUBGCP6Q96RT7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TUBGCP6Q96RT7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TUBGCP6Q96RT7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TUBGCP6Q96RT7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TUBGCP6Q96RT7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TUBGCP6Q96RT7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TUBGCP6Q96RT7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TUBGCP6Q96RT7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TUBGCP6Q96RT7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TUBGCP6Q96RT7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TUBGCP6Q96RT7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TUBGCP6Q96RT7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TUBGCP6Q96RT7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TUBGCP6Q96RT7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TUBGCP6Q96RT7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
TUBGCP6Q96RT7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TUBGCP6Q96RT7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TUBGCP6Q96RT7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TUBGCP6Q96RT7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TUBGCP6Q96RT7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TUBGCP6Q96RT7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
TUBGCP6Q96RT7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms