Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UIMC1Q96RL1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UIMC1Q96RL1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UIMC1Q96RL1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
UIMC1Q96RL1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UIMC1Q96RL1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
UIMC1Q96RL1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UIMC1Q96RL1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UIMC1Q96RL1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
UIMC1Q96RL1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
UIMC1Q96RL1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UIMC1Q96RL1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
UIMC1Q96RL1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
UIMC1Q96RL1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UIMC1Q96RL1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UIMC1Q96RL1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UIMC1Q96RL1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UIMC1Q96RL1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UIMC1Q96RL1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UIMC1Q96RL1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UIMC1Q96RL1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UIMC1Q96RL1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
UIMC1Q96RL1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
UIMC1Q96RL1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
UIMC1Q96RL1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UIMC1Q96RL1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
UIMC1Q96RL1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
UIMC1Q96RL1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
UIMC1Q96RL1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
UIMC1Q96RL1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UIMC1Q96RL1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UIMC1Q96RL1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UIMC1Q96RL1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
UIMC1Q96RL1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UIMC1Q96RL1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UIMC1Q96RL1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
UIMC1Q96RL1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UIMC1Q96RL1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UIMC1Q96RL1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UIMC1Q96RL1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
UIMC1Q96RL1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UIMC1Q96RL1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UIMC1Q96RL1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
UIMC1Q96RL1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
UIMC1Q96RL1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
UIMC1Q96RL1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
UIMC1Q96RL1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UIMC1Q96RL1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UIMC1Q96RL1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UIMC1Q96RL1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UIMC1Q96RL1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
UIMC1Q96RL1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
UIMC1Q96RL1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
UIMC1Q96RL1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
UIMC1Q96RL1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
UIMC1Q96RL1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
UIMC1Q96RL1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UIMC1Q96RL1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
UIMC1Q96RL1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
UIMC1Q96RL1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
UIMC1Q96RL1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
UIMC1Q96RL1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
UIMC1Q96RL1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
UIMC1Q96RL1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
UIMC1Q96RL1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
UIMC1Q96RL1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
UIMC1Q96RL1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
UIMC1Q96RL1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
UIMC1Q96RL1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
UIMC1Q96RL1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
UIMC1Q96RL1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
UIMC1Q96RL1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
UIMC1Q96RL1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
UIMC1Q96RL1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UIMC1Q96RL1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UIMC1Q96RL1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UIMC1Q96RL1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
UIMC1Q96RL1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UIMC1Q96RL1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UIMC1Q96RL1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UIMC1Q96RL1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UIMC1Q96RL1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
UIMC1Q96RL1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UIMC1Q96RL1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
UIMC1Q96RL1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UIMC1Q96RL1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UIMC1Q96RL1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UIMC1Q96RL1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UIMC1Q96RL1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UIMC1Q96RL1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
UIMC1Q96RL1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UIMC1Q96RL1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UIMC1Q96RL1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UIMC1Q96RL1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
UIMC1Q96RL1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UIMC1Q96RL1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
UIMC1Q96RL1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UIMC1Q96RL1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UIMC1Q96RL1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UIMC1Q96RL1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms