Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV6

HIST1H2AA, Histone H2A type 1-A, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H2AAQ96QV6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIST1H2AAQ96QV6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIST1H2AAQ96QV6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIST1H2AAQ96QV6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST1H2AAQ96QV6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST1H2AAQ96QV6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST1H2AAQ96QV6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIST1H2AAQ96QV6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIST1H2AAQ96QV6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIST1H2AAQ96QV6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIST1H2AAQ96QV6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST1H2AAQ96QV6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST1H2AAQ96QV6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST1H2AAQ96QV6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIST1H2AAQ96QV6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIST1H2AAQ96QV6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HIST1H2AAQ96QV6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIST1H2AAQ96QV6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIST1H2AAQ96QV6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIST1H2AAQ96QV6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIST1H2AAQ96QV6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIST1H2AAQ96QV6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIST1H2AAQ96QV6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HIST1H2AAQ96QV6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIST1H2AAQ96QV6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIST1H2AAQ96QV6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIST1H2AAQ96QV6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIST1H2AAQ96QV6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIST1H2AAQ96QV6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIST1H2AAQ96QV6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST1H2AAQ96QV6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST1H2AAQ96QV6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST1H2AAQ96QV6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIST1H2AAQ96QV6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIST1H2AAQ96QV6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIST1H2AAQ96QV6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIST1H2AAQ96QV6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIST1H2AAQ96QV6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIST1H2AAQ96QV6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIST1H2AAQ96QV6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIST1H2AAQ96QV6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIST1H2AAQ96QV6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIST1H2AAQ96QV6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIST1H2AAQ96QV6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIST1H2AAQ96QV6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIST1H2AAQ96QV6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HIST1H2AAQ96QV6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIST1H2AAQ96QV6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIST1H2AAQ96QV6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIST1H2AAQ96QV6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIST1H2AAQ96QV6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIST1H2AAQ96QV6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST1H2AAQ96QV6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST1H2AAQ96QV6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST1H2AAQ96QV6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST1H2AAQ96QV6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST1H2AAQ96QV6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST1H2AAQ96QV6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HIST1H2AAQ96QV6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIST1H2AAQ96QV6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIST1H2AAQ96QV6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIST1H2AAQ96QV6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIST1H2AAQ96QV6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIST1H2AAQ96QV6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIST1H2AAQ96QV6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIST1H2AAQ96QV6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIST1H2AAQ96QV6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIST1H2AAQ96QV6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIST1H2AAQ96QV6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIST1H2AAQ96QV6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIST1H2AAQ96QV6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIST1H2AAQ96QV6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIST1H2AAQ96QV6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HIST1H2AAQ96QV6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIST1H2AAQ96QV6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIST1H2AAQ96QV6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIST1H2AAQ96QV6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HIST1H2AAQ96QV6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIST1H2AAQ96QV6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIST1H2AAQ96QV6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIST1H2AAQ96QV6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIST1H2AAQ96QV6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HIST1H2AAQ96QV6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIST1H2AAQ96QV6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIST1H2AAQ96QV6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIST1H2AAQ96QV6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIST1H2AAQ96QV6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIST1H2AAQ96QV6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIST1H2AAQ96QV6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIST1H2AAQ96QV6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIST1H2AAQ96QV6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIST1H2AAQ96QV6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIST1H2AAQ96QV6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIST1H2AAQ96QV6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIST1H2AAQ96QV6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIST1H2AAQ96QV6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIST1H2AAQ96QV6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIST1H2AAQ96QV6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIST1H2AAQ96QV6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIST1H2AAQ96QV6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms