Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYNGAP1Q96PV0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYNGAP1Q96PV0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYNGAP1Q96PV0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYNGAP1Q96PV0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNGAP1Q96PV0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNGAP1Q96PV0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNGAP1Q96PV0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNGAP1Q96PV0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNGAP1Q96PV0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNGAP1Q96PV0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNGAP1Q96PV0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNGAP1Q96PV0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYNGAP1Q96PV0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SYNGAP1Q96PV0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYNGAP1Q96PV0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYNGAP1Q96PV0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYNGAP1Q96PV0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYNGAP1Q96PV0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNGAP1Q96PV0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYNGAP1Q96PV0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYNGAP1Q96PV0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNGAP1Q96PV0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNGAP1Q96PV0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNGAP1Q96PV0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNGAP1Q96PV0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNGAP1Q96PV0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYNGAP1Q96PV0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYNGAP1Q96PV0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYNGAP1Q96PV0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYNGAP1Q96PV0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYNGAP1Q96PV0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNGAP1Q96PV0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYNGAP1Q96PV0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
SYNGAP1Q96PV0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
SYNGAP1Q96PV0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
SYNGAP1Q96PV0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
SYNGAP1Q96PV0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
SYNGAP1Q96PV0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
SYNGAP1Q96PV0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
SYNGAP1Q96PV0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
SYNGAP1Q96PV0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
SYNGAP1Q96PV0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYNGAP1Q96PV0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYNGAP1Q96PV0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYNGAP1Q96PV0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYNGAP1Q96PV0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYNGAP1Q96PV0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYNGAP1Q96PV0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYNGAP1Q96PV0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYNGAP1Q96PV0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYNGAP1Q96PV0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYNGAP1Q96PV0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SYNGAP1Q96PV0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNGAP1Q96PV0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNGAP1Q96PV0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNGAP1Q96PV0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNGAP1Q96PV0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYNGAP1Q96PV0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNGAP1Q96PV0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNGAP1Q96PV0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNGAP1Q96PV0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNGAP1Q96PV0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNGAP1Q96PV0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNGAP1Q96PV0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNGAP1Q96PV0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNGAP1Q96PV0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNGAP1Q96PV0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNGAP1Q96PV0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNGAP1Q96PV0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNGAP1Q96PV0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNGAP1Q96PV0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNGAP1Q96PV0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNGAP1Q96PV0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNGAP1Q96PV0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNGAP1Q96PV0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNGAP1Q96PV0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNGAP1Q96PV0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNGAP1Q96PV0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNGAP1Q96PV0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNGAP1Q96PV0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNGAP1Q96PV0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNGAP1Q96PV0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNGAP1Q96PV0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYNGAP1Q96PV0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYNGAP1Q96PV0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYNGAP1Q96PV0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYNGAP1Q96PV0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYNGAP1Q96PV0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNGAP1Q96PV0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNGAP1Q96PV0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNGAP1Q96PV0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNGAP1Q96PV0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNGAP1Q96PV0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNGAP1Q96PV0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNGAP1Q96PV0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNGAP1Q96PV0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNGAP1Q96PV0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNGAP1Q96PV0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms