Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BICD1Q96G01 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BICD1Q96G01 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BICD1Q96G01 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BICD1Q96G01 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BICD1Q96G01 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
BICD1Q96G01 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BICD1Q96G01 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BICD1Q96G01 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BICD1Q96G01 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BICD1Q96G01 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BICD1Q96G01 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
BICD1Q96G01 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BICD1Q96G01 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BICD1Q96G01 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BICD1Q96G01 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BICD1Q96G01 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BICD1Q96G01 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BICD1Q96G01 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BICD1Q96G01 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BICD1Q96G01 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BICD1Q96G01 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BICD1Q96G01 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BICD1Q96G01 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BICD1Q96G01 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
BICD1Q96G01 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BICD1Q96G01 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BICD1Q96G01 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BICD1Q96G01 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BICD1Q96G01 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BICD1Q96G01 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BICD1Q96G01 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BICD1Q96G01 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BICD1Q96G01 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BICD1Q96G01 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BICD1Q96G01 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BICD1Q96G01 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BICD1Q96G01 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BICD1Q96G01 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BICD1Q96G01 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
BICD1Q96G01 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BICD1Q96G01 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BICD1Q96G01 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BICD1Q96G01 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BICD1Q96G01 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BICD1Q96G01 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BICD1Q96G01 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BICD1Q96G01 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BICD1Q96G01 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BICD1Q96G01 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BICD1Q96G01 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BICD1Q96G01 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BICD1Q96G01 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BICD1Q96G01 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BICD1Q96G01 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
BICD1Q96G01 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BICD1Q96G01 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BICD1Q96G01 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BICD1Q96G01 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
BICD1Q96G01 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BICD1Q96G01 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BICD1Q96G01 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BICD1Q96G01 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BICD1Q96G01 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BICD1Q96G01 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BICD1Q96G01 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BICD1Q96G01 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BICD1Q96G01 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BICD1Q96G01 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BICD1Q96G01 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BICD1Q96G01 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BICD1Q96G01 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BICD1Q96G01 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BICD1Q96G01 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BICD1Q96G01 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BICD1Q96G01 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BICD1Q96G01 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BICD1Q96G01 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BICD1Q96G01 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BICD1Q96G01 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BICD1Q96G01 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BICD1Q96G01 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BICD1Q96G01 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
BICD1Q96G01 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BICD1Q96G01 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BICD1Q96G01 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BICD1Q96G01 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BICD1Q96G01 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BICD1Q96G01 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BICD1Q96G01 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
BICD1Q96G01 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BICD1Q96G01 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BICD1Q96G01 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BICD1Q96G01 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BICD1Q96G01 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BICD1Q96G01 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BICD1Q96G01 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BICD1Q96G01 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BICD1Q96G01 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BICD1Q96G01 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms