Protein–RNA interactions for Protein: Q96FL8

SLC47A1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC47A1Q96FL8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC47A1Q96FL8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC47A1Q96FL8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC47A1Q96FL8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC47A1Q96FL8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC47A1Q96FL8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC47A1Q96FL8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC47A1Q96FL8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC47A1Q96FL8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC47A1Q96FL8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC47A1Q96FL8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC47A1Q96FL8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC47A1Q96FL8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC47A1Q96FL8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC47A1Q96FL8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC47A1Q96FL8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC47A1Q96FL8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC47A1Q96FL8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC47A1Q96FL8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC47A1Q96FL8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC47A1Q96FL8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC47A1Q96FL8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC47A1Q96FL8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC47A1Q96FL8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC47A1Q96FL8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC47A1Q96FL8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC47A1Q96FL8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC47A1Q96FL8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC47A1Q96FL8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC47A1Q96FL8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC47A1Q96FL8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC47A1Q96FL8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC47A1Q96FL8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC47A1Q96FL8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC47A1Q96FL8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC47A1Q96FL8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC47A1Q96FL8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC47A1Q96FL8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC47A1Q96FL8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC47A1Q96FL8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC47A1Q96FL8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC47A1Q96FL8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC47A1Q96FL8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC47A1Q96FL8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC47A1Q96FL8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC47A1Q96FL8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC47A1Q96FL8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC47A1Q96FL8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC47A1Q96FL8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC47A1Q96FL8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC47A1Q96FL8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC47A1Q96FL8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC47A1Q96FL8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC47A1Q96FL8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC47A1Q96FL8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC47A1Q96FL8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC47A1Q96FL8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC47A1Q96FL8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC47A1Q96FL8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC47A1Q96FL8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC47A1Q96FL8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC47A1Q96FL8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC47A1Q96FL8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC47A1Q96FL8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC47A1Q96FL8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC47A1Q96FL8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC47A1Q96FL8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC47A1Q96FL8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC47A1Q96FL8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC47A1Q96FL8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC47A1Q96FL8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC47A1Q96FL8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC47A1Q96FL8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC47A1Q96FL8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC47A1Q96FL8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC47A1Q96FL8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC47A1Q96FL8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC47A1Q96FL8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC47A1Q96FL8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC47A1Q96FL8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC47A1Q96FL8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC47A1Q96FL8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC47A1Q96FL8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC47A1Q96FL8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC47A1Q96FL8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC47A1Q96FL8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC47A1Q96FL8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC47A1Q96FL8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC47A1Q96FL8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC47A1Q96FL8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC47A1Q96FL8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC47A1Q96FL8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC47A1Q96FL8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC47A1Q96FL8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC47A1Q96FL8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC47A1Q96FL8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC47A1Q96FL8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC47A1Q96FL8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC47A1Q96FL8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC47A1Q96FL8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms