Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PABPC5Q96DU9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PABPC5Q96DU9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PABPC5Q96DU9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PABPC5Q96DU9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PABPC5Q96DU9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PABPC5Q96DU9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PABPC5Q96DU9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PABPC5Q96DU9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PABPC5Q96DU9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PABPC5Q96DU9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PABPC5Q96DU9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PABPC5Q96DU9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PABPC5Q96DU9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PABPC5Q96DU9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PABPC5Q96DU9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PABPC5Q96DU9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PABPC5Q96DU9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PABPC5Q96DU9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PABPC5Q96DU9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PABPC5Q96DU9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PABPC5Q96DU9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PABPC5Q96DU9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PABPC5Q96DU9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PABPC5Q96DU9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PABPC5Q96DU9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PABPC5Q96DU9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PABPC5Q96DU9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PABPC5Q96DU9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PABPC5Q96DU9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PABPC5Q96DU9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PABPC5Q96DU9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PABPC5Q96DU9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PABPC5Q96DU9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PABPC5Q96DU9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PABPC5Q96DU9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PABPC5Q96DU9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PABPC5Q96DU9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PABPC5Q96DU9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PABPC5Q96DU9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PABPC5Q96DU9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PABPC5Q96DU9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PABPC5Q96DU9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PABPC5Q96DU9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PABPC5Q96DU9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PABPC5Q96DU9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PABPC5Q96DU9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PABPC5Q96DU9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PABPC5Q96DU9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PABPC5Q96DU9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PABPC5Q96DU9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PABPC5Q96DU9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PABPC5Q96DU9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PABPC5Q96DU9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PABPC5Q96DU9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PABPC5Q96DU9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PABPC5Q96DU9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PABPC5Q96DU9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PABPC5Q96DU9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PABPC5Q96DU9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PABPC5Q96DU9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PABPC5Q96DU9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PABPC5Q96DU9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PABPC5Q96DU9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PABPC5Q96DU9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PABPC5Q96DU9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PABPC5Q96DU9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PABPC5Q96DU9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PABPC5Q96DU9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PABPC5Q96DU9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PABPC5Q96DU9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PABPC5Q96DU9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PABPC5Q96DU9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PABPC5Q96DU9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PABPC5Q96DU9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PABPC5Q96DU9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PABPC5Q96DU9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PABPC5Q96DU9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PABPC5Q96DU9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PABPC5Q96DU9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PABPC5Q96DU9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PABPC5Q96DU9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PABPC5Q96DU9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PABPC5Q96DU9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PABPC5Q96DU9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PABPC5Q96DU9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PABPC5Q96DU9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PABPC5Q96DU9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PABPC5Q96DU9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PABPC5Q96DU9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PABPC5Q96DU9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PABPC5Q96DU9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PABPC5Q96DU9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PABPC5Q96DU9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PABPC5Q96DU9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PABPC5Q96DU9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PABPC5Q96DU9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PABPC5Q96DU9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PABPC5Q96DU9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PABPC5Q96DU9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms