Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERP27Q96DN0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERP27Q96DN0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERP27Q96DN0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ERP27Q96DN0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERP27Q96DN0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERP27Q96DN0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERP27Q96DN0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ERP27Q96DN0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERP27Q96DN0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERP27Q96DN0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERP27Q96DN0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ERP27Q96DN0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERP27Q96DN0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERP27Q96DN0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERP27Q96DN0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERP27Q96DN0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERP27Q96DN0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERP27Q96DN0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERP27Q96DN0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERP27Q96DN0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERP27Q96DN0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ERP27Q96DN0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERP27Q96DN0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERP27Q96DN0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERP27Q96DN0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERP27Q96DN0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERP27Q96DN0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERP27Q96DN0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERP27Q96DN0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERP27Q96DN0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERP27Q96DN0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERP27Q96DN0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERP27Q96DN0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERP27Q96DN0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERP27Q96DN0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERP27Q96DN0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERP27Q96DN0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERP27Q96DN0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERP27Q96DN0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERP27Q96DN0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERP27Q96DN0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERP27Q96DN0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERP27Q96DN0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERP27Q96DN0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERP27Q96DN0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ERP27Q96DN0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERP27Q96DN0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERP27Q96DN0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERP27Q96DN0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERP27Q96DN0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERP27Q96DN0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERP27Q96DN0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERP27Q96DN0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERP27Q96DN0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ERP27Q96DN0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERP27Q96DN0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERP27Q96DN0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERP27Q96DN0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERP27Q96DN0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERP27Q96DN0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERP27Q96DN0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERP27Q96DN0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERP27Q96DN0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERP27Q96DN0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERP27Q96DN0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERP27Q96DN0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERP27Q96DN0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERP27Q96DN0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERP27Q96DN0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERP27Q96DN0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERP27Q96DN0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERP27Q96DN0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERP27Q96DN0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERP27Q96DN0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERP27Q96DN0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERP27Q96DN0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERP27Q96DN0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERP27Q96DN0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERP27Q96DN0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERP27Q96DN0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERP27Q96DN0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERP27Q96DN0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERP27Q96DN0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERP27Q96DN0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERP27Q96DN0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERP27Q96DN0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERP27Q96DN0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERP27Q96DN0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERP27Q96DN0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERP27Q96DN0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERP27Q96DN0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERP27Q96DN0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERP27Q96DN0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERP27Q96DN0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERP27Q96DN0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERP27Q96DN0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERP27Q96DN0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERP27Q96DN0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERP27Q96DN0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms