Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM8

ACSF2, Acyl-CoA synthetase family member 2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSF2Q96CM8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACSF2Q96CM8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ACSF2Q96CM8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACSF2Q96CM8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACSF2Q96CM8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACSF2Q96CM8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACSF2Q96CM8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACSF2Q96CM8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACSF2Q96CM8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACSF2Q96CM8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACSF2Q96CM8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ACSF2Q96CM8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ACSF2Q96CM8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ACSF2Q96CM8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACSF2Q96CM8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACSF2Q96CM8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACSF2Q96CM8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACSF2Q96CM8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ACSF2Q96CM8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ACSF2Q96CM8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACSF2Q96CM8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACSF2Q96CM8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ACSF2Q96CM8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACSF2Q96CM8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACSF2Q96CM8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACSF2Q96CM8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACSF2Q96CM8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACSF2Q96CM8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACSF2Q96CM8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACSF2Q96CM8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACSF2Q96CM8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACSF2Q96CM8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACSF2Q96CM8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACSF2Q96CM8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACSF2Q96CM8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACSF2Q96CM8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ACSF2Q96CM8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ACSF2Q96CM8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ACSF2Q96CM8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ACSF2Q96CM8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ACSF2Q96CM8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACSF2Q96CM8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACSF2Q96CM8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACSF2Q96CM8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACSF2Q96CM8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ACSF2Q96CM8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ACSF2Q96CM8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ACSF2Q96CM8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ACSF2Q96CM8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ACSF2Q96CM8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACSF2Q96CM8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACSF2Q96CM8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACSF2Q96CM8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACSF2Q96CM8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACSF2Q96CM8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACSF2Q96CM8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACSF2Q96CM8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACSF2Q96CM8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACSF2Q96CM8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACSF2Q96CM8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACSF2Q96CM8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACSF2Q96CM8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACSF2Q96CM8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACSF2Q96CM8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACSF2Q96CM8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACSF2Q96CM8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACSF2Q96CM8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACSF2Q96CM8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACSF2Q96CM8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACSF2Q96CM8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACSF2Q96CM8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ACSF2Q96CM8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACSF2Q96CM8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ACSF2Q96CM8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ACSF2Q96CM8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ACSF2Q96CM8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACSF2Q96CM8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACSF2Q96CM8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACSF2Q96CM8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACSF2Q96CM8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACSF2Q96CM8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACSF2Q96CM8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACSF2Q96CM8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACSF2Q96CM8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACSF2Q96CM8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACSF2Q96CM8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACSF2Q96CM8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACSF2Q96CM8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACSF2Q96CM8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACSF2Q96CM8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACSF2Q96CM8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACSF2Q96CM8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACSF2Q96CM8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACSF2Q96CM8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACSF2Q96CM8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACSF2Q96CM8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACSF2Q96CM8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACSF2Q96CM8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACSF2Q96CM8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ACSF2Q96CM8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms