Protein–RNA interactions for Protein: Q96AX1

VPS33A, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS33AQ96AX1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS33AQ96AX1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS33AQ96AX1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS33AQ96AX1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS33AQ96AX1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS33AQ96AX1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS33AQ96AX1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS33AQ96AX1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS33AQ96AX1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS33AQ96AX1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS33AQ96AX1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS33AQ96AX1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS33AQ96AX1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS33AQ96AX1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS33AQ96AX1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS33AQ96AX1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS33AQ96AX1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS33AQ96AX1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS33AQ96AX1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS33AQ96AX1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS33AQ96AX1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS33AQ96AX1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS33AQ96AX1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS33AQ96AX1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS33AQ96AX1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS33AQ96AX1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS33AQ96AX1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS33AQ96AX1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS33AQ96AX1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS33AQ96AX1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS33AQ96AX1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS33AQ96AX1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS33AQ96AX1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS33AQ96AX1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS33AQ96AX1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS33AQ96AX1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS33AQ96AX1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS33AQ96AX1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS33AQ96AX1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS33AQ96AX1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS33AQ96AX1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS33AQ96AX1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS33AQ96AX1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS33AQ96AX1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS33AQ96AX1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS33AQ96AX1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS33AQ96AX1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS33AQ96AX1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS33AQ96AX1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS33AQ96AX1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS33AQ96AX1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS33AQ96AX1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS33AQ96AX1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS33AQ96AX1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS33AQ96AX1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS33AQ96AX1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS33AQ96AX1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS33AQ96AX1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS33AQ96AX1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS33AQ96AX1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS33AQ96AX1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS33AQ96AX1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS33AQ96AX1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS33AQ96AX1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS33AQ96AX1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS33AQ96AX1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS33AQ96AX1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS33AQ96AX1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS33AQ96AX1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS33AQ96AX1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS33AQ96AX1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS33AQ96AX1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS33AQ96AX1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS33AQ96AX1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS33AQ96AX1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS33AQ96AX1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS33AQ96AX1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS33AQ96AX1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS33AQ96AX1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS33AQ96AX1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS33AQ96AX1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS33AQ96AX1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS33AQ96AX1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS33AQ96AX1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS33AQ96AX1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS33AQ96AX1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS33AQ96AX1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS33AQ96AX1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS33AQ96AX1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS33AQ96AX1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS33AQ96AX1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS33AQ96AX1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS33AQ96AX1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS33AQ96AX1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS33AQ96AX1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS33AQ96AX1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms