Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
LRRC59Q96AG4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
LRRC59Q96AG4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
LRRC59Q96AG4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
LRRC59Q96AG4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
LRRC59Q96AG4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
LRRC59Q96AG4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
LRRC59Q96AG4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
LRRC59Q96AG4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
LRRC59Q96AG4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
LRRC59Q96AG4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
LRRC59Q96AG4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
LRRC59Q96AG4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
LRRC59Q96AG4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
LRRC59Q96AG4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
LRRC59Q96AG4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
LRRC59Q96AG4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
LRRC59Q96AG4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
LRRC59Q96AG4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
LRRC59Q96AG4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
LRRC59Q96AG4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
LRRC59Q96AG4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
LRRC59Q96AG4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
LRRC59Q96AG4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LRRC59Q96AG4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
LRRC59Q96AG4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
LRRC59Q96AG4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
LRRC59Q96AG4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
LRRC59Q96AG4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
LRRC59Q96AG4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
LRRC59Q96AG4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
LRRC59Q96AG4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
LRRC59Q96AG4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
LRRC59Q96AG4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
LRRC59Q96AG4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
LRRC59Q96AG4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
LRRC59Q96AG4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
LRRC59Q96AG4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
LRRC59Q96AG4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
LRRC59Q96AG4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
LRRC59Q96AG4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
LRRC59Q96AG4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
LRRC59Q96AG4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
LRRC59Q96AG4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
LRRC59Q96AG4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
LRRC59Q96AG4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
LRRC59Q96AG4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
LRRC59Q96AG4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
LRRC59Q96AG4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
LRRC59Q96AG4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
LRRC59Q96AG4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
LRRC59Q96AG4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
LRRC59Q96AG4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
LRRC59Q96AG4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
LRRC59Q96AG4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
LRRC59Q96AG4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
LRRC59Q96AG4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
LRRC59Q96AG4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
LRRC59Q96AG4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
LRRC59Q96AG4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
LRRC59Q96AG4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
LRRC59Q96AG4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
LRRC59Q96AG4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
LRRC59Q96AG4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
LRRC59Q96AG4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
LRRC59Q96AG4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
LRRC59Q96AG4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
LRRC59Q96AG4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
LRRC59Q96AG4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
LRRC59Q96AG4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
LRRC59Q96AG4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
LRRC59Q96AG4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
LRRC59Q96AG4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
LRRC59Q96AG4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
LRRC59Q96AG4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
LRRC59Q96AG4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
LRRC59Q96AG4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
LRRC59Q96AG4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
LRRC59Q96AG4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
LRRC59Q96AG4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
LRRC59Q96AG4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
LRRC59Q96AG4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
LRRC59Q96AG4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
LRRC59Q96AG4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
LRRC59Q96AG4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
LRRC59Q96AG4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
LRRC59Q96AG4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
LRRC59Q96AG4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
LRRC59Q96AG4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
LRRC59Q96AG4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
LRRC59Q96AG4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LRRC59Q96AG4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
LRRC59Q96AG4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
LRRC59Q96AG4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
LRRC59Q96AG4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
LRRC59Q96AG4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
LRRC59Q96AG4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
LRRC59Q96AG4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
LRRC59Q96AG4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
LRRC59Q96AG4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms