Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y2

GTPBP3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP3Q969Y2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTPBP3Q969Y2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTPBP3Q969Y2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTPBP3Q969Y2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTPBP3Q969Y2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTPBP3Q969Y2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTPBP3Q969Y2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTPBP3Q969Y2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTPBP3Q969Y2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTPBP3Q969Y2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTPBP3Q969Y2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTPBP3Q969Y2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTPBP3Q969Y2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTPBP3Q969Y2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTPBP3Q969Y2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTPBP3Q969Y2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTPBP3Q969Y2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTPBP3Q969Y2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTPBP3Q969Y2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTPBP3Q969Y2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTPBP3Q969Y2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTPBP3Q969Y2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GTPBP3Q969Y2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTPBP3Q969Y2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTPBP3Q969Y2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTPBP3Q969Y2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTPBP3Q969Y2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTPBP3Q969Y2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTPBP3Q969Y2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GTPBP3Q969Y2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTPBP3Q969Y2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTPBP3Q969Y2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTPBP3Q969Y2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTPBP3Q969Y2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTPBP3Q969Y2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTPBP3Q969Y2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTPBP3Q969Y2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GTPBP3Q969Y2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTPBP3Q969Y2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTPBP3Q969Y2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTPBP3Q969Y2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTPBP3Q969Y2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTPBP3Q969Y2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTPBP3Q969Y2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTPBP3Q969Y2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTPBP3Q969Y2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTPBP3Q969Y2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTPBP3Q969Y2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTPBP3Q969Y2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTPBP3Q969Y2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTPBP3Q969Y2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTPBP3Q969Y2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTPBP3Q969Y2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTPBP3Q969Y2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTPBP3Q969Y2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTPBP3Q969Y2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTPBP3Q969Y2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTPBP3Q969Y2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTPBP3Q969Y2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTPBP3Q969Y2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTPBP3Q969Y2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GTPBP3Q969Y2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTPBP3Q969Y2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTPBP3Q969Y2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GTPBP3Q969Y2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTPBP3Q969Y2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GTPBP3Q969Y2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTPBP3Q969Y2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTPBP3Q969Y2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTPBP3Q969Y2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTPBP3Q969Y2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTPBP3Q969Y2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GTPBP3Q969Y2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTPBP3Q969Y2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTPBP3Q969Y2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTPBP3Q969Y2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTPBP3Q969Y2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTPBP3Q969Y2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTPBP3Q969Y2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTPBP3Q969Y2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTPBP3Q969Y2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTPBP3Q969Y2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTPBP3Q969Y2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTPBP3Q969Y2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTPBP3Q969Y2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTPBP3Q969Y2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTPBP3Q969Y2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTPBP3Q969Y2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTPBP3Q969Y2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GTPBP3Q969Y2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTPBP3Q969Y2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTPBP3Q969Y2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTPBP3Q969Y2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTPBP3Q969Y2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTPBP3Q969Y2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTPBP3Q969Y2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GTPBP3Q969Y2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTPBP3Q969Y2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTPBP3Q969Y2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTPBP3Q969Y2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms