Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW18

C17orf50, Uncharacterized protein C17orf50, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf50Q8WW18 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C17orf50Q8WW18 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C17orf50Q8WW18 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf50Q8WW18 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf50Q8WW18 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C17orf50Q8WW18 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C17orf50Q8WW18 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C17orf50Q8WW18 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C17orf50Q8WW18 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C17orf50Q8WW18 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C17orf50Q8WW18 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C17orf50Q8WW18 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C17orf50Q8WW18 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C17orf50Q8WW18 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C17orf50Q8WW18 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C17orf50Q8WW18 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C17orf50Q8WW18 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C17orf50Q8WW18 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C17orf50Q8WW18 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C17orf50Q8WW18 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C17orf50Q8WW18 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C17orf50Q8WW18 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C17orf50Q8WW18 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C17orf50Q8WW18 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C17orf50Q8WW18 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C17orf50Q8WW18 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C17orf50Q8WW18 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C17orf50Q8WW18 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C17orf50Q8WW18 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C17orf50Q8WW18 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C17orf50Q8WW18 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C17orf50Q8WW18 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C17orf50Q8WW18 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C17orf50Q8WW18 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C17orf50Q8WW18 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C17orf50Q8WW18 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C17orf50Q8WW18 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C17orf50Q8WW18 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C17orf50Q8WW18 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C17orf50Q8WW18 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C17orf50Q8WW18 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C17orf50Q8WW18 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C17orf50Q8WW18 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C17orf50Q8WW18 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C17orf50Q8WW18 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C17orf50Q8WW18 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C17orf50Q8WW18 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C17orf50Q8WW18 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C17orf50Q8WW18 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C17orf50Q8WW18 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C17orf50Q8WW18 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C17orf50Q8WW18 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C17orf50Q8WW18 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C17orf50Q8WW18 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C17orf50Q8WW18 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf50Q8WW18 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C17orf50Q8WW18 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C17orf50Q8WW18 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C17orf50Q8WW18 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C17orf50Q8WW18 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf50Q8WW18 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf50Q8WW18 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C17orf50Q8WW18 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf50Q8WW18 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C17orf50Q8WW18 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C17orf50Q8WW18 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C17orf50Q8WW18 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C17orf50Q8WW18 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C17orf50Q8WW18 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C17orf50Q8WW18 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C17orf50Q8WW18 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms