Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX33Q8WV41 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX33Q8WV41 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX33Q8WV41 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX33Q8WV41 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX33Q8WV41 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX33Q8WV41 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX33Q8WV41 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX33Q8WV41 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX33Q8WV41 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX33Q8WV41 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX33Q8WV41 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX33Q8WV41 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX33Q8WV41 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX33Q8WV41 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX33Q8WV41 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX33Q8WV41 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX33Q8WV41 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX33Q8WV41 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX33Q8WV41 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX33Q8WV41 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX33Q8WV41 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX33Q8WV41 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX33Q8WV41 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX33Q8WV41 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX33Q8WV41 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX33Q8WV41 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX33Q8WV41 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX33Q8WV41 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX33Q8WV41 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX33Q8WV41 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX33Q8WV41 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX33Q8WV41 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX33Q8WV41 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX33Q8WV41 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX33Q8WV41 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX33Q8WV41 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX33Q8WV41 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX33Q8WV41 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX33Q8WV41 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX33Q8WV41 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX33Q8WV41 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX33Q8WV41 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX33Q8WV41 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX33Q8WV41 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX33Q8WV41 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX33Q8WV41 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX33Q8WV41 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX33Q8WV41 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX33Q8WV41 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX33Q8WV41 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX33Q8WV41 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX33Q8WV41 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX33Q8WV41 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX33Q8WV41 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX33Q8WV41 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX33Q8WV41 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX33Q8WV41 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX33Q8WV41 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX33Q8WV41 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX33Q8WV41 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX33Q8WV41 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX33Q8WV41 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX33Q8WV41 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX33Q8WV41 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX33Q8WV41 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX33Q8WV41 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX33Q8WV41 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX33Q8WV41 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX33Q8WV41 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX33Q8WV41 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX33Q8WV41 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX33Q8WV41 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX33Q8WV41 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX33Q8WV41 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms