Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY9

DEPDC1B, DEP domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1BQ8WUY9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DEPDC1BQ8WUY9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DEPDC1BQ8WUY9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DEPDC1BQ8WUY9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DEPDC1BQ8WUY9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
DEPDC1BQ8WUY9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DEPDC1BQ8WUY9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DEPDC1BQ8WUY9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
DEPDC1BQ8WUY9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DEPDC1BQ8WUY9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DEPDC1BQ8WUY9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DEPDC1BQ8WUY9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DEPDC1BQ8WUY9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DEPDC1BQ8WUY9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DEPDC1BQ8WUY9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DEPDC1BQ8WUY9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DEPDC1BQ8WUY9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DEPDC1BQ8WUY9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
DEPDC1BQ8WUY9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DEPDC1BQ8WUY9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DEPDC1BQ8WUY9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DEPDC1BQ8WUY9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DEPDC1BQ8WUY9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DEPDC1BQ8WUY9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DEPDC1BQ8WUY9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DEPDC1BQ8WUY9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DEPDC1BQ8WUY9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DEPDC1BQ8WUY9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DEPDC1BQ8WUY9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DEPDC1BQ8WUY9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DEPDC1BQ8WUY9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DEPDC1BQ8WUY9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DEPDC1BQ8WUY9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DEPDC1BQ8WUY9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DEPDC1BQ8WUY9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DEPDC1BQ8WUY9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DEPDC1BQ8WUY9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DEPDC1BQ8WUY9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DEPDC1BQ8WUY9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DEPDC1BQ8WUY9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEPDC1BQ8WUY9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DEPDC1BQ8WUY9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DEPDC1BQ8WUY9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DEPDC1BQ8WUY9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DEPDC1BQ8WUY9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DEPDC1BQ8WUY9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DEPDC1BQ8WUY9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DEPDC1BQ8WUY9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DEPDC1BQ8WUY9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DEPDC1BQ8WUY9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DEPDC1BQ8WUY9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DEPDC1BQ8WUY9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DEPDC1BQ8WUY9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DEPDC1BQ8WUY9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DEPDC1BQ8WUY9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DEPDC1BQ8WUY9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DEPDC1BQ8WUY9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DEPDC1BQ8WUY9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DEPDC1BQ8WUY9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DEPDC1BQ8WUY9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DEPDC1BQ8WUY9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
DEPDC1BQ8WUY9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DEPDC1BQ8WUY9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DEPDC1BQ8WUY9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DEPDC1BQ8WUY9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DEPDC1BQ8WUY9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DEPDC1BQ8WUY9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DEPDC1BQ8WUY9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
DEPDC1BQ8WUY9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DEPDC1BQ8WUY9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DEPDC1BQ8WUY9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DEPDC1BQ8WUY9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DEPDC1BQ8WUY9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DEPDC1BQ8WUY9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DEPDC1BQ8WUY9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DEPDC1BQ8WUY9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC1BQ8WUY9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
DEPDC1BQ8WUY9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DEPDC1BQ8WUY9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DEPDC1BQ8WUY9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DEPDC1BQ8WUY9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DEPDC1BQ8WUY9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DEPDC1BQ8WUY9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DEPDC1BQ8WUY9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DEPDC1BQ8WUY9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DEPDC1BQ8WUY9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DEPDC1BQ8WUY9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DEPDC1BQ8WUY9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DEPDC1BQ8WUY9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DEPDC1BQ8WUY9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DEPDC1BQ8WUY9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DEPDC1BQ8WUY9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DEPDC1BQ8WUY9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DEPDC1BQ8WUY9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DEPDC1BQ8WUY9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DEPDC1BQ8WUY9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DEPDC1BQ8WUY9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DEPDC1BQ8WUY9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DEPDC1BQ8WUY9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DEPDC1BQ8WUY9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms