Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY6

ZFP28, Zinc finger protein 28 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP28Q8NHY6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFP28Q8NHY6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZFP28Q8NHY6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZFP28Q8NHY6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFP28Q8NHY6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFP28Q8NHY6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFP28Q8NHY6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFP28Q8NHY6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFP28Q8NHY6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFP28Q8NHY6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFP28Q8NHY6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFP28Q8NHY6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFP28Q8NHY6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFP28Q8NHY6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFP28Q8NHY6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFP28Q8NHY6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFP28Q8NHY6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFP28Q8NHY6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFP28Q8NHY6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFP28Q8NHY6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZFP28Q8NHY6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZFP28Q8NHY6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZFP28Q8NHY6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFP28Q8NHY6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFP28Q8NHY6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFP28Q8NHY6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFP28Q8NHY6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFP28Q8NHY6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFP28Q8NHY6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZFP28Q8NHY6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZFP28Q8NHY6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZFP28Q8NHY6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZFP28Q8NHY6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZFP28Q8NHY6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZFP28Q8NHY6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZFP28Q8NHY6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFP28Q8NHY6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFP28Q8NHY6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFP28Q8NHY6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFP28Q8NHY6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFP28Q8NHY6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFP28Q8NHY6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFP28Q8NHY6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFP28Q8NHY6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZFP28Q8NHY6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZFP28Q8NHY6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZFP28Q8NHY6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZFP28Q8NHY6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZFP28Q8NHY6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZFP28Q8NHY6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZFP28Q8NHY6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZFP28Q8NHY6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZFP28Q8NHY6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZFP28Q8NHY6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZFP28Q8NHY6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ZFP28Q8NHY6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZFP28Q8NHY6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZFP28Q8NHY6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZFP28Q8NHY6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZFP28Q8NHY6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZFP28Q8NHY6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZFP28Q8NHY6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZFP28Q8NHY6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFP28Q8NHY6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFP28Q8NHY6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZFP28Q8NHY6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZFP28Q8NHY6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZFP28Q8NHY6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms