Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC89Q8N998 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC89Q8N998 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC89Q8N998 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC89Q8N998 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC89Q8N998 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC89Q8N998 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC89Q8N998 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC89Q8N998 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC89Q8N998 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC89Q8N998 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC89Q8N998 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC89Q8N998 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC89Q8N998 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC89Q8N998 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC89Q8N998 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC89Q8N998 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC89Q8N998 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC89Q8N998 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC89Q8N998 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC89Q8N998 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC89Q8N998 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC89Q8N998 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC89Q8N998 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC89Q8N998 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC89Q8N998 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC89Q8N998 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC89Q8N998 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC89Q8N998 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC89Q8N998 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC89Q8N998 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC89Q8N998 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC89Q8N998 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC89Q8N998 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC89Q8N998 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC89Q8N998 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC89Q8N998 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC89Q8N998 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC89Q8N998 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC89Q8N998 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC89Q8N998 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC89Q8N998 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC89Q8N998 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC89Q8N998 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC89Q8N998 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC89Q8N998 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC89Q8N998 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC89Q8N998 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC89Q8N998 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC89Q8N998 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC89Q8N998 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC89Q8N998 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC89Q8N998 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC89Q8N998 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC89Q8N998 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC89Q8N998 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC89Q8N998 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC89Q8N998 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC89Q8N998 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC89Q8N998 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC89Q8N998 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC89Q8N998 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC89Q8N998 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC89Q8N998 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC89Q8N998 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC89Q8N998 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC89Q8N998 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC89Q8N998 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC89Q8N998 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC89Q8N998 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC89Q8N998 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC89Q8N998 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC89Q8N998 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC89Q8N998 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC89Q8N998 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC89Q8N998 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms