Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms