Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
VPS8Q8N3P4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
VPS8Q8N3P4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
VPS8Q8N3P4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
VPS8Q8N3P4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
VPS8Q8N3P4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
VPS8Q8N3P4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.73■■■■■ 4.27
VPS8Q8N3P4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
VPS8Q8N3P4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
VPS8Q8N3P4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
VPS8Q8N3P4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
VPS8Q8N3P4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
VPS8Q8N3P4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
VPS8Q8N3P4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
VPS8Q8N3P4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
VPS8Q8N3P4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
VPS8Q8N3P4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
VPS8Q8N3P4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
VPS8Q8N3P4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
VPS8Q8N3P4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
VPS8Q8N3P4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
VPS8Q8N3P4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
VPS8Q8N3P4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
VPS8Q8N3P4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
VPS8Q8N3P4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
VPS8Q8N3P4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
VPS8Q8N3P4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
VPS8Q8N3P4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
VPS8Q8N3P4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
VPS8Q8N3P4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
VPS8Q8N3P4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
VPS8Q8N3P4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
VPS8Q8N3P4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
VPS8Q8N3P4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
VPS8Q8N3P4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
VPS8Q8N3P4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
VPS8Q8N3P4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
VPS8Q8N3P4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
VPS8Q8N3P4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
VPS8Q8N3P4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC41.52■■■■■ 4.24
VPS8Q8N3P4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
VPS8Q8N3P4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
VPS8Q8N3P4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC41.49■■■■■ 4.23
VPS8Q8N3P4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
VPS8Q8N3P4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
VPS8Q8N3P4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
VPS8Q8N3P4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
VPS8Q8N3P4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
VPS8Q8N3P4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
VPS8Q8N3P4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
VPS8Q8N3P4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.22
VPS8Q8N3P4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
VPS8Q8N3P4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
VPS8Q8N3P4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
VPS8Q8N3P4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
VPS8Q8N3P4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
VPS8Q8N3P4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
VPS8Q8N3P4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
VPS8Q8N3P4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC41.39■■■■■ 4.22
VPS8Q8N3P4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
VPS8Q8N3P4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
VPS8Q8N3P4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.38■■■■■ 4.22
VPS8Q8N3P4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
VPS8Q8N3P4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
VPS8Q8N3P4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
VPS8Q8N3P4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
VPS8Q8N3P4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
VPS8Q8N3P4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
VPS8Q8N3P4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
VPS8Q8N3P4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
VPS8Q8N3P4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
VPS8Q8N3P4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
VPS8Q8N3P4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
VPS8Q8N3P4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
VPS8Q8N3P4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
VPS8Q8N3P4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
VPS8Q8N3P4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
VPS8Q8N3P4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
VPS8Q8N3P4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC41.32■■■■■ 4.21
VPS8Q8N3P4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
VPS8Q8N3P4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
VPS8Q8N3P4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
VPS8Q8N3P4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
VPS8Q8N3P4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
VPS8Q8N3P4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
VPS8Q8N3P4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
VPS8Q8N3P4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
VPS8Q8N3P4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
VPS8Q8N3P4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
VPS8Q8N3P4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
VPS8Q8N3P4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
VPS8Q8N3P4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
VPS8Q8N3P4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
VPS8Q8N3P4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
VPS8Q8N3P4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
VPS8Q8N3P4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
VPS8Q8N3P4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
VPS8Q8N3P4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
VPS8Q8N3P4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
VPS8Q8N3P4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms