Protein–RNA interactions for Protein: Q8N145

LGI3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI3Q8N145 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGI3Q8N145 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LGI3Q8N145 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LGI3Q8N145 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LGI3Q8N145 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGI3Q8N145 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGI3Q8N145 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGI3Q8N145 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGI3Q8N145 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGI3Q8N145 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGI3Q8N145 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGI3Q8N145 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGI3Q8N145 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGI3Q8N145 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LGI3Q8N145 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LGI3Q8N145 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LGI3Q8N145 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LGI3Q8N145 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LGI3Q8N145 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LGI3Q8N145 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LGI3Q8N145 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LGI3Q8N145 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LGI3Q8N145 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LGI3Q8N145 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LGI3Q8N145 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LGI3Q8N145 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LGI3Q8N145 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LGI3Q8N145 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LGI3Q8N145 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGI3Q8N145 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGI3Q8N145 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGI3Q8N145 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGI3Q8N145 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGI3Q8N145 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LGI3Q8N145 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LGI3Q8N145 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LGI3Q8N145 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LGI3Q8N145 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LGI3Q8N145 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LGI3Q8N145 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LGI3Q8N145 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LGI3Q8N145 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LGI3Q8N145 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LGI3Q8N145 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LGI3Q8N145 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LGI3Q8N145 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LGI3Q8N145 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LGI3Q8N145 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LGI3Q8N145 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LGI3Q8N145 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LGI3Q8N145 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LGI3Q8N145 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LGI3Q8N145 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LGI3Q8N145 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LGI3Q8N145 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LGI3Q8N145 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LGI3Q8N145 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGI3Q8N145 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGI3Q8N145 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGI3Q8N145 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGI3Q8N145 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGI3Q8N145 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGI3Q8N145 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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LGI3Q8N145 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGI3Q8N145 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGI3Q8N145 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGI3Q8N145 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGI3Q8N145 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGI3Q8N145 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGI3Q8N145 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGI3Q8N145 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LGI3Q8N145 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LGI3Q8N145 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LGI3Q8N145 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGI3Q8N145 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGI3Q8N145 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGI3Q8N145 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGI3Q8N145 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGI3Q8N145 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGI3Q8N145 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGI3Q8N145 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGI3Q8N145 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGI3Q8N145 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGI3Q8N145 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGI3Q8N145 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGI3Q8N145 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGI3Q8N145 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGI3Q8N145 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGI3Q8N145 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGI3Q8N145 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGI3Q8N145 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGI3Q8N145 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGI3Q8N145 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGI3Q8N145 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGI3Q8N145 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGI3Q8N145 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LGI3Q8N145 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
LGI3Q8N145 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LGI3Q8N145 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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