Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT20Q8IY31 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT20Q8IY31 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT20Q8IY31 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT20Q8IY31 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT20Q8IY31 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT20Q8IY31 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT20Q8IY31 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT20Q8IY31 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT20Q8IY31 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT20Q8IY31 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT20Q8IY31 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT20Q8IY31 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
IFT20Q8IY31 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT20Q8IY31 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT20Q8IY31 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT20Q8IY31 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT20Q8IY31 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT20Q8IY31 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFT20Q8IY31 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT20Q8IY31 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT20Q8IY31 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT20Q8IY31 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT20Q8IY31 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT20Q8IY31 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT20Q8IY31 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT20Q8IY31 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT20Q8IY31 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT20Q8IY31 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT20Q8IY31 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT20Q8IY31 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT20Q8IY31 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT20Q8IY31 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT20Q8IY31 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT20Q8IY31 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT20Q8IY31 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT20Q8IY31 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT20Q8IY31 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT20Q8IY31 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT20Q8IY31 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT20Q8IY31 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT20Q8IY31 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT20Q8IY31 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT20Q8IY31 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT20Q8IY31 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT20Q8IY31 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT20Q8IY31 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT20Q8IY31 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT20Q8IY31 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT20Q8IY31 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT20Q8IY31 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT20Q8IY31 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT20Q8IY31 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT20Q8IY31 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT20Q8IY31 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT20Q8IY31 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT20Q8IY31 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT20Q8IY31 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT20Q8IY31 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT20Q8IY31 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT20Q8IY31 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT20Q8IY31 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT20Q8IY31 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT20Q8IY31 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT20Q8IY31 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT20Q8IY31 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT20Q8IY31 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT20Q8IY31 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT20Q8IY31 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT20Q8IY31 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT20Q8IY31 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT20Q8IY31 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT20Q8IY31 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT20Q8IY31 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT20Q8IY31 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT20Q8IY31 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT20Q8IY31 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT20Q8IY31 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT20Q8IY31 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT20Q8IY31 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFT20Q8IY31 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
IFT20Q8IY31 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFT20Q8IY31 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFT20Q8IY31 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFT20Q8IY31 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT20Q8IY31 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT20Q8IY31 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT20Q8IY31 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT20Q8IY31 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFT20Q8IY31 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFT20Q8IY31 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFT20Q8IY31 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT20Q8IY31 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT20Q8IY31 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT20Q8IY31 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT20Q8IY31 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT20Q8IY31 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
IFT20Q8IY31 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IFT20Q8IY31 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFT20Q8IY31 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms