Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ4

GPALPP1, GPALPP motifs-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPALPP1Q8IXQ4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPALPP1Q8IXQ4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPALPP1Q8IXQ4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPALPP1Q8IXQ4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPALPP1Q8IXQ4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPALPP1Q8IXQ4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPALPP1Q8IXQ4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPALPP1Q8IXQ4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPALPP1Q8IXQ4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPALPP1Q8IXQ4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPALPP1Q8IXQ4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPALPP1Q8IXQ4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPALPP1Q8IXQ4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPALPP1Q8IXQ4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPALPP1Q8IXQ4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPALPP1Q8IXQ4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPALPP1Q8IXQ4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPALPP1Q8IXQ4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPALPP1Q8IXQ4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPALPP1Q8IXQ4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPALPP1Q8IXQ4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms