Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ5

TRIM42, Tripartite motif-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM42Q8IWZ5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM42Q8IWZ5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM42Q8IWZ5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM42Q8IWZ5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM42Q8IWZ5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM42Q8IWZ5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM42Q8IWZ5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM42Q8IWZ5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM42Q8IWZ5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM42Q8IWZ5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM42Q8IWZ5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM42Q8IWZ5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM42Q8IWZ5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM42Q8IWZ5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM42Q8IWZ5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM42Q8IWZ5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM42Q8IWZ5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM42Q8IWZ5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM42Q8IWZ5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM42Q8IWZ5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM42Q8IWZ5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM42Q8IWZ5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM42Q8IWZ5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM42Q8IWZ5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM42Q8IWZ5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM42Q8IWZ5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM42Q8IWZ5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM42Q8IWZ5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM42Q8IWZ5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM42Q8IWZ5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM42Q8IWZ5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM42Q8IWZ5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM42Q8IWZ5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM42Q8IWZ5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM42Q8IWZ5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM42Q8IWZ5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM42Q8IWZ5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM42Q8IWZ5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM42Q8IWZ5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM42Q8IWZ5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM42Q8IWZ5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM42Q8IWZ5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM42Q8IWZ5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM42Q8IWZ5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM42Q8IWZ5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM42Q8IWZ5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM42Q8IWZ5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM42Q8IWZ5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM42Q8IWZ5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM42Q8IWZ5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM42Q8IWZ5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM42Q8IWZ5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM42Q8IWZ5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM42Q8IWZ5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM42Q8IWZ5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM42Q8IWZ5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM42Q8IWZ5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM42Q8IWZ5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM42Q8IWZ5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM42Q8IWZ5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM42Q8IWZ5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM42Q8IWZ5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM42Q8IWZ5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM42Q8IWZ5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM42Q8IWZ5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM42Q8IWZ5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM42Q8IWZ5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM42Q8IWZ5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM42Q8IWZ5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM42Q8IWZ5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM42Q8IWZ5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM42Q8IWZ5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM42Q8IWZ5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM42Q8IWZ5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM42Q8IWZ5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM42Q8IWZ5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM42Q8IWZ5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM42Q8IWZ5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM42Q8IWZ5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM42Q8IWZ5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM42Q8IWZ5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM42Q8IWZ5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TRIM42Q8IWZ5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM42Q8IWZ5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM42Q8IWZ5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM42Q8IWZ5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM42Q8IWZ5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM42Q8IWZ5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM42Q8IWZ5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM42Q8IWZ5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM42Q8IWZ5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM42Q8IWZ5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM42Q8IWZ5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM42Q8IWZ5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM42Q8IWZ5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM42Q8IWZ5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM42Q8IWZ5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM42Q8IWZ5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM42Q8IWZ5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM42Q8IWZ5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms