Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC28Q86X40 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC28Q86X40 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC28Q86X40 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC28Q86X40 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC28Q86X40 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC28Q86X40 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC28Q86X40 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC28Q86X40 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC28Q86X40 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC28Q86X40 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC28Q86X40 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC28Q86X40 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC28Q86X40 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC28Q86X40 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC28Q86X40 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC28Q86X40 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC28Q86X40 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC28Q86X40 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC28Q86X40 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC28Q86X40 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC28Q86X40 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC28Q86X40 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC28Q86X40 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC28Q86X40 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC28Q86X40 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC28Q86X40 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC28Q86X40 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC28Q86X40 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC28Q86X40 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC28Q86X40 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC28Q86X40 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC28Q86X40 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC28Q86X40 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC28Q86X40 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC28Q86X40 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRRC28Q86X40 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC28Q86X40 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC28Q86X40 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC28Q86X40 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC28Q86X40 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC28Q86X40 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC28Q86X40 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC28Q86X40 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC28Q86X40 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC28Q86X40 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC28Q86X40 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC28Q86X40 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC28Q86X40 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC28Q86X40 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC28Q86X40 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC28Q86X40 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC28Q86X40 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC28Q86X40 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC28Q86X40 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC28Q86X40 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC28Q86X40 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC28Q86X40 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC28Q86X40 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC28Q86X40 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC28Q86X40 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC28Q86X40 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC28Q86X40 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC28Q86X40 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC28Q86X40 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC28Q86X40 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC28Q86X40 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC28Q86X40 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC28Q86X40 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms