Protein–RNA interactions for Protein: Q86VZ4

LRP11, Low-density lipoprotein receptor-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP11Q86VZ4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP11Q86VZ4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP11Q86VZ4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP11Q86VZ4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP11Q86VZ4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP11Q86VZ4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP11Q86VZ4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP11Q86VZ4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP11Q86VZ4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP11Q86VZ4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP11Q86VZ4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP11Q86VZ4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRP11Q86VZ4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRP11Q86VZ4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRP11Q86VZ4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP11Q86VZ4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP11Q86VZ4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP11Q86VZ4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP11Q86VZ4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP11Q86VZ4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP11Q86VZ4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRP11Q86VZ4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP11Q86VZ4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP11Q86VZ4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP11Q86VZ4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP11Q86VZ4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP11Q86VZ4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP11Q86VZ4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP11Q86VZ4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP11Q86VZ4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP11Q86VZ4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP11Q86VZ4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP11Q86VZ4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP11Q86VZ4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP11Q86VZ4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP11Q86VZ4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP11Q86VZ4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP11Q86VZ4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP11Q86VZ4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP11Q86VZ4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP11Q86VZ4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP11Q86VZ4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP11Q86VZ4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP11Q86VZ4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP11Q86VZ4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP11Q86VZ4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP11Q86VZ4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP11Q86VZ4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP11Q86VZ4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP11Q86VZ4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP11Q86VZ4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP11Q86VZ4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP11Q86VZ4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP11Q86VZ4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP11Q86VZ4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP11Q86VZ4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP11Q86VZ4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRP11Q86VZ4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP11Q86VZ4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRP11Q86VZ4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRP11Q86VZ4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP11Q86VZ4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP11Q86VZ4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP11Q86VZ4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP11Q86VZ4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP11Q86VZ4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRP11Q86VZ4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP11Q86VZ4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRP11Q86VZ4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP11Q86VZ4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRP11Q86VZ4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRP11Q86VZ4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP11Q86VZ4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms