Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT62

BARGIN, Bargin, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARGINQ6ZT62 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
BARGINQ6ZT62 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
BARGINQ6ZT62 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
BARGINQ6ZT62 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
BARGINQ6ZT62 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
BARGINQ6ZT62 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
BARGINQ6ZT62 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
BARGINQ6ZT62 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
BARGINQ6ZT62 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
BARGINQ6ZT62 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
BARGINQ6ZT62 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
BARGINQ6ZT62 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
BARGINQ6ZT62 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
BARGINQ6ZT62 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
BARGINQ6ZT62 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
BARGINQ6ZT62 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
BARGINQ6ZT62 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
BARGINQ6ZT62 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
BARGINQ6ZT62 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
BARGINQ6ZT62 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
BARGINQ6ZT62 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
BARGINQ6ZT62 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
BARGINQ6ZT62 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
BARGINQ6ZT62 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
BARGINQ6ZT62 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
BARGINQ6ZT62 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
BARGINQ6ZT62 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
BARGINQ6ZT62 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
BARGINQ6ZT62 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
BARGINQ6ZT62 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
BARGINQ6ZT62 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
BARGINQ6ZT62 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
BARGINQ6ZT62 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
BARGINQ6ZT62 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
BARGINQ6ZT62 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
BARGINQ6ZT62 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
BARGINQ6ZT62 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
BARGINQ6ZT62 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
BARGINQ6ZT62 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
BARGINQ6ZT62 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
BARGINQ6ZT62 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
BARGINQ6ZT62 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
BARGINQ6ZT62 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
BARGINQ6ZT62 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
BARGINQ6ZT62 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
BARGINQ6ZT62 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
BARGINQ6ZT62 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
BARGINQ6ZT62 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
BARGINQ6ZT62 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
BARGINQ6ZT62 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
BARGINQ6ZT62 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
BARGINQ6ZT62 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
BARGINQ6ZT62 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
BARGINQ6ZT62 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
BARGINQ6ZT62 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
BARGINQ6ZT62 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
BARGINQ6ZT62 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
BARGINQ6ZT62 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BARGINQ6ZT62 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BARGINQ6ZT62 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
BARGINQ6ZT62 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BARGINQ6ZT62 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BARGINQ6ZT62 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
BARGINQ6ZT62 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
BARGINQ6ZT62 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
BARGINQ6ZT62 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BARGINQ6ZT62 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
BARGINQ6ZT62 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
BARGINQ6ZT62 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
BARGINQ6ZT62 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
BARGINQ6ZT62 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
BARGINQ6ZT62 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
BARGINQ6ZT62 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
BARGINQ6ZT62 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
BARGINQ6ZT62 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
BARGINQ6ZT62 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
BARGINQ6ZT62 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
BARGINQ6ZT62 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
BARGINQ6ZT62 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
BARGINQ6ZT62 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
BARGINQ6ZT62 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
BARGINQ6ZT62 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
BARGINQ6ZT62 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
BARGINQ6ZT62 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
BARGINQ6ZT62 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
BARGINQ6ZT62 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
BARGINQ6ZT62 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
BARGINQ6ZT62 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
BARGINQ6ZT62 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
BARGINQ6ZT62 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
BARGINQ6ZT62 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
BARGINQ6ZT62 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
BARGINQ6ZT62 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
BARGINQ6ZT62 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
BARGINQ6ZT62 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
BARGINQ6ZT62 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
BARGINQ6ZT62 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
BARGINQ6ZT62 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
BARGINQ6ZT62 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
BARGINQ6ZT62 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms