Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00299Q6ZSB3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00299Q6ZSB3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00299Q6ZSB3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00299Q6ZSB3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00299Q6ZSB3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00299Q6ZSB3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00299Q6ZSB3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00299Q6ZSB3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00299Q6ZSB3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00299Q6ZSB3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00299Q6ZSB3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00299Q6ZSB3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00299Q6ZSB3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00299Q6ZSB3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00299Q6ZSB3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00299Q6ZSB3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00299Q6ZSB3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00299Q6ZSB3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00299Q6ZSB3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00299Q6ZSB3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00299Q6ZSB3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00299Q6ZSB3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00299Q6ZSB3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00299Q6ZSB3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00299Q6ZSB3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00299Q6ZSB3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00299Q6ZSB3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00299Q6ZSB3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00299Q6ZSB3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00299Q6ZSB3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00299Q6ZSB3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00299Q6ZSB3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00299Q6ZSB3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00299Q6ZSB3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00299Q6ZSB3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00299Q6ZSB3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00299Q6ZSB3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00299Q6ZSB3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00299Q6ZSB3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00299Q6ZSB3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00299Q6ZSB3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00299Q6ZSB3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00299Q6ZSB3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00299Q6ZSB3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00299Q6ZSB3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00299Q6ZSB3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00299Q6ZSB3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00299Q6ZSB3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00299Q6ZSB3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00299Q6ZSB3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00299Q6ZSB3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00299Q6ZSB3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00299Q6ZSB3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00299Q6ZSB3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms