Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf47Q6ZRZ4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf47Q6ZRZ4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf47Q6ZRZ4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf47Q6ZRZ4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf47Q6ZRZ4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf47Q6ZRZ4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf47Q6ZRZ4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C9orf47Q6ZRZ4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C9orf47Q6ZRZ4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C9orf47Q6ZRZ4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C9orf47Q6ZRZ4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C9orf47Q6ZRZ4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C9orf47Q6ZRZ4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
C9orf47Q6ZRZ4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C9orf47Q6ZRZ4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C9orf47Q6ZRZ4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf47Q6ZRZ4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms