Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NFXL1Q6ZNB6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NFXL1Q6ZNB6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NFXL1Q6ZNB6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NFXL1Q6ZNB6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NFXL1Q6ZNB6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NFXL1Q6ZNB6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NFXL1Q6ZNB6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NFXL1Q6ZNB6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NFXL1Q6ZNB6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NFXL1Q6ZNB6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NFXL1Q6ZNB6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NFXL1Q6ZNB6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NFXL1Q6ZNB6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NFXL1Q6ZNB6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NFXL1Q6ZNB6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NFXL1Q6ZNB6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NFXL1Q6ZNB6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NFXL1Q6ZNB6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NFXL1Q6ZNB6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NFXL1Q6ZNB6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NFXL1Q6ZNB6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
NFXL1Q6ZNB6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
NFXL1Q6ZNB6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NFXL1Q6ZNB6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NFXL1Q6ZNB6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NFXL1Q6ZNB6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NFXL1Q6ZNB6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NFXL1Q6ZNB6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NFXL1Q6ZNB6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NFXL1Q6ZNB6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NFXL1Q6ZNB6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NFXL1Q6ZNB6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NFXL1Q6ZNB6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NFXL1Q6ZNB6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NFXL1Q6ZNB6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NFXL1Q6ZNB6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NFXL1Q6ZNB6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NFXL1Q6ZNB6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NFXL1Q6ZNB6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NFXL1Q6ZNB6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NFXL1Q6ZNB6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
NFXL1Q6ZNB6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NFXL1Q6ZNB6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
NFXL1Q6ZNB6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NFXL1Q6ZNB6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NFXL1Q6ZNB6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NFXL1Q6ZNB6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NFXL1Q6ZNB6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NFXL1Q6ZNB6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NFXL1Q6ZNB6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NFXL1Q6ZNB6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NFXL1Q6ZNB6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NFXL1Q6ZNB6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
NFXL1Q6ZNB6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NFXL1Q6ZNB6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NFXL1Q6ZNB6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NFXL1Q6ZNB6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NFXL1Q6ZNB6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NFXL1Q6ZNB6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NFXL1Q6ZNB6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NFXL1Q6ZNB6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NFXL1Q6ZNB6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NFXL1Q6ZNB6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NFXL1Q6ZNB6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NFXL1Q6ZNB6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NFXL1Q6ZNB6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NFXL1Q6ZNB6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NFXL1Q6ZNB6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NFXL1Q6ZNB6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NFXL1Q6ZNB6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
NFXL1Q6ZNB6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NFXL1Q6ZNB6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NFXL1Q6ZNB6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NFXL1Q6ZNB6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NFXL1Q6ZNB6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NFXL1Q6ZNB6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NFXL1Q6ZNB6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NFXL1Q6ZNB6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NFXL1Q6ZNB6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NFXL1Q6ZNB6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NFXL1Q6ZNB6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NFXL1Q6ZNB6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NFXL1Q6ZNB6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NFXL1Q6ZNB6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NFXL1Q6ZNB6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NFXL1Q6ZNB6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NFXL1Q6ZNB6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NFXL1Q6ZNB6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NFXL1Q6ZNB6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NFXL1Q6ZNB6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NFXL1Q6ZNB6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NFXL1Q6ZNB6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NFXL1Q6ZNB6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NFXL1Q6ZNB6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NFXL1Q6ZNB6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
NFXL1Q6ZNB6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
NFXL1Q6ZNB6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NFXL1Q6ZNB6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms