Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMC5Q6UXY8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMC5Q6UXY8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMC5Q6UXY8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TMC5Q6UXY8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMC5Q6UXY8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TMC5Q6UXY8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TMC5Q6UXY8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TMC5Q6UXY8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TMC5Q6UXY8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TMC5Q6UXY8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TMC5Q6UXY8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TMC5Q6UXY8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TMC5Q6UXY8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMC5Q6UXY8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMC5Q6UXY8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMC5Q6UXY8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMC5Q6UXY8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMC5Q6UXY8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMC5Q6UXY8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMC5Q6UXY8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMC5Q6UXY8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMC5Q6UXY8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMC5Q6UXY8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMC5Q6UXY8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMC5Q6UXY8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMC5Q6UXY8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMC5Q6UXY8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMC5Q6UXY8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMC5Q6UXY8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMC5Q6UXY8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMC5Q6UXY8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMC5Q6UXY8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMC5Q6UXY8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMC5Q6UXY8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMC5Q6UXY8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMC5Q6UXY8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TMC5Q6UXY8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMC5Q6UXY8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMC5Q6UXY8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMC5Q6UXY8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMC5Q6UXY8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMC5Q6UXY8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMC5Q6UXY8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMC5Q6UXY8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMC5Q6UXY8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMC5Q6UXY8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMC5Q6UXY8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMC5Q6UXY8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMC5Q6UXY8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMC5Q6UXY8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMC5Q6UXY8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMC5Q6UXY8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMC5Q6UXY8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMC5Q6UXY8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMC5Q6UXY8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMC5Q6UXY8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMC5Q6UXY8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMC5Q6UXY8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMC5Q6UXY8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMC5Q6UXY8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMC5Q6UXY8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMC5Q6UXY8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMC5Q6UXY8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMC5Q6UXY8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMC5Q6UXY8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMC5Q6UXY8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMC5Q6UXY8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMC5Q6UXY8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMC5Q6UXY8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMC5Q6UXY8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMC5Q6UXY8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMC5Q6UXY8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMC5Q6UXY8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMC5Q6UXY8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMC5Q6UXY8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMC5Q6UXY8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC5Q6UXY8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC5Q6UXY8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC5Q6UXY8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC5Q6UXY8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC5Q6UXY8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC5Q6UXY8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC5Q6UXY8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC5Q6UXY8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC5Q6UXY8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC5Q6UXY8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC5Q6UXY8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC5Q6UXY8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC5Q6UXY8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC5Q6UXY8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC5Q6UXY8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC5Q6UXY8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC5Q6UXY8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC5Q6UXY8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC5Q6UXY8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMC5Q6UXY8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMC5Q6UXY8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMC5Q6UXY8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMC5Q6UXY8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms