Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRAIDQ6UW56 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRAIDQ6UW56 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRAIDQ6UW56 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRAIDQ6UW56 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRAIDQ6UW56 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRAIDQ6UW56 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRAIDQ6UW56 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRAIDQ6UW56 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRAIDQ6UW56 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRAIDQ6UW56 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRAIDQ6UW56 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRAIDQ6UW56 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRAIDQ6UW56 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATRAIDQ6UW56 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATRAIDQ6UW56 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRAIDQ6UW56 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRAIDQ6UW56 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRAIDQ6UW56 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRAIDQ6UW56 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRAIDQ6UW56 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRAIDQ6UW56 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRAIDQ6UW56 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRAIDQ6UW56 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRAIDQ6UW56 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRAIDQ6UW56 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRAIDQ6UW56 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRAIDQ6UW56 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRAIDQ6UW56 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRAIDQ6UW56 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRAIDQ6UW56 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRAIDQ6UW56 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRAIDQ6UW56 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRAIDQ6UW56 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATRAIDQ6UW56 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATRAIDQ6UW56 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATRAIDQ6UW56 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRAIDQ6UW56 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRAIDQ6UW56 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRAIDQ6UW56 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRAIDQ6UW56 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRAIDQ6UW56 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRAIDQ6UW56 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRAIDQ6UW56 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRAIDQ6UW56 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRAIDQ6UW56 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRAIDQ6UW56 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRAIDQ6UW56 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRAIDQ6UW56 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRAIDQ6UW56 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRAIDQ6UW56 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRAIDQ6UW56 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRAIDQ6UW56 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRAIDQ6UW56 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRAIDQ6UW56 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRAIDQ6UW56 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRAIDQ6UW56 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRAIDQ6UW56 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRAIDQ6UW56 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATRAIDQ6UW56 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATRAIDQ6UW56 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATRAIDQ6UW56 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATRAIDQ6UW56 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATRAIDQ6UW56 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRAIDQ6UW56 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRAIDQ6UW56 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRAIDQ6UW56 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRAIDQ6UW56 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRAIDQ6UW56 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRAIDQ6UW56 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRAIDQ6UW56 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRAIDQ6UW56 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRAIDQ6UW56 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRAIDQ6UW56 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRAIDQ6UW56 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRAIDQ6UW56 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATRAIDQ6UW56 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRAIDQ6UW56 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRAIDQ6UW56 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATRAIDQ6UW56 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATRAIDQ6UW56 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATRAIDQ6UW56 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRAIDQ6UW56 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATRAIDQ6UW56 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATRAIDQ6UW56 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRAIDQ6UW56 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRAIDQ6UW56 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRAIDQ6UW56 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATRAIDQ6UW56 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATRAIDQ6UW56 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATRAIDQ6UW56 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATRAIDQ6UW56 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATRAIDQ6UW56 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATRAIDQ6UW56 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATRAIDQ6UW56 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATRAIDQ6UW56 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATRAIDQ6UW56 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATRAIDQ6UW56 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATRAIDQ6UW56 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATRAIDQ6UW56 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms