Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2M8

PNCK, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCKQ6P2M8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNCKQ6P2M8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNCKQ6P2M8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNCKQ6P2M8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNCKQ6P2M8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNCKQ6P2M8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PNCKQ6P2M8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNCKQ6P2M8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PNCKQ6P2M8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PNCKQ6P2M8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNCKQ6P2M8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNCKQ6P2M8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNCKQ6P2M8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNCKQ6P2M8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNCKQ6P2M8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNCKQ6P2M8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNCKQ6P2M8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNCKQ6P2M8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNCKQ6P2M8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNCKQ6P2M8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNCKQ6P2M8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PNCKQ6P2M8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNCKQ6P2M8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNCKQ6P2M8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNCKQ6P2M8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNCKQ6P2M8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNCKQ6P2M8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNCKQ6P2M8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNCKQ6P2M8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PNCKQ6P2M8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PNCKQ6P2M8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNCKQ6P2M8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNCKQ6P2M8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNCKQ6P2M8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNCKQ6P2M8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PNCKQ6P2M8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNCKQ6P2M8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNCKQ6P2M8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNCKQ6P2M8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNCKQ6P2M8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNCKQ6P2M8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNCKQ6P2M8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNCKQ6P2M8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNCKQ6P2M8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNCKQ6P2M8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNCKQ6P2M8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNCKQ6P2M8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNCKQ6P2M8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PNCKQ6P2M8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNCKQ6P2M8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNCKQ6P2M8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNCKQ6P2M8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNCKQ6P2M8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNCKQ6P2M8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNCKQ6P2M8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNCKQ6P2M8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNCKQ6P2M8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNCKQ6P2M8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNCKQ6P2M8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNCKQ6P2M8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNCKQ6P2M8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PNCKQ6P2M8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PNCKQ6P2M8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNCKQ6P2M8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNCKQ6P2M8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNCKQ6P2M8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNCKQ6P2M8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNCKQ6P2M8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNCKQ6P2M8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNCKQ6P2M8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNCKQ6P2M8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNCKQ6P2M8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNCKQ6P2M8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNCKQ6P2M8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNCKQ6P2M8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNCKQ6P2M8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNCKQ6P2M8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNCKQ6P2M8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNCKQ6P2M8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNCKQ6P2M8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNCKQ6P2M8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNCKQ6P2M8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNCKQ6P2M8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNCKQ6P2M8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNCKQ6P2M8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNCKQ6P2M8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNCKQ6P2M8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNCKQ6P2M8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNCKQ6P2M8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNCKQ6P2M8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNCKQ6P2M8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNCKQ6P2M8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PNCKQ6P2M8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNCKQ6P2M8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNCKQ6P2M8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNCKQ6P2M8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNCKQ6P2M8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNCKQ6P2M8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNCKQ6P2M8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNCKQ6P2M8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms