Protein–RNA interactions for Protein: Q6IAA8

LAMTOR1, Ragulator complex protein LAMTOR1, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR1Q6IAA8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMTOR1Q6IAA8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMTOR1Q6IAA8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMTOR1Q6IAA8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMTOR1Q6IAA8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMTOR1Q6IAA8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMTOR1Q6IAA8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMTOR1Q6IAA8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMTOR1Q6IAA8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMTOR1Q6IAA8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMTOR1Q6IAA8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMTOR1Q6IAA8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMTOR1Q6IAA8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMTOR1Q6IAA8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMTOR1Q6IAA8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMTOR1Q6IAA8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMTOR1Q6IAA8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMTOR1Q6IAA8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LAMTOR1Q6IAA8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMTOR1Q6IAA8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMTOR1Q6IAA8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMTOR1Q6IAA8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMTOR1Q6IAA8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMTOR1Q6IAA8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMTOR1Q6IAA8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMTOR1Q6IAA8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMTOR1Q6IAA8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMTOR1Q6IAA8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMTOR1Q6IAA8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMTOR1Q6IAA8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMTOR1Q6IAA8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMTOR1Q6IAA8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMTOR1Q6IAA8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMTOR1Q6IAA8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMTOR1Q6IAA8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMTOR1Q6IAA8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMTOR1Q6IAA8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMTOR1Q6IAA8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMTOR1Q6IAA8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMTOR1Q6IAA8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMTOR1Q6IAA8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMTOR1Q6IAA8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMTOR1Q6IAA8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMTOR1Q6IAA8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMTOR1Q6IAA8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMTOR1Q6IAA8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMTOR1Q6IAA8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMTOR1Q6IAA8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMTOR1Q6IAA8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMTOR1Q6IAA8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMTOR1Q6IAA8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMTOR1Q6IAA8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMTOR1Q6IAA8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMTOR1Q6IAA8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMTOR1Q6IAA8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMTOR1Q6IAA8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMTOR1Q6IAA8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMTOR1Q6IAA8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMTOR1Q6IAA8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMTOR1Q6IAA8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMTOR1Q6IAA8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMTOR1Q6IAA8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMTOR1Q6IAA8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMTOR1Q6IAA8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMTOR1Q6IAA8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMTOR1Q6IAA8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMTOR1Q6IAA8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMTOR1Q6IAA8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMTOR1Q6IAA8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMTOR1Q6IAA8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMTOR1Q6IAA8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMTOR1Q6IAA8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMTOR1Q6IAA8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMTOR1Q6IAA8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMTOR1Q6IAA8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMTOR1Q6IAA8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMTOR1Q6IAA8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMTOR1Q6IAA8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMTOR1Q6IAA8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMTOR1Q6IAA8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMTOR1Q6IAA8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMTOR1Q6IAA8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMTOR1Q6IAA8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMTOR1Q6IAA8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMTOR1Q6IAA8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMTOR1Q6IAA8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMTOR1Q6IAA8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMTOR1Q6IAA8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMTOR1Q6IAA8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMTOR1Q6IAA8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMTOR1Q6IAA8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMTOR1Q6IAA8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMTOR1Q6IAA8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMTOR1Q6IAA8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMTOR1Q6IAA8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMTOR1Q6IAA8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMTOR1Q6IAA8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMTOR1Q6IAA8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMTOR1Q6IAA8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMTOR1Q6IAA8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms