Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
INTS3Q68E01 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
INTS3Q68E01 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
INTS3Q68E01 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
INTS3Q68E01 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
INTS3Q68E01 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
INTS3Q68E01 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
INTS3Q68E01 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
INTS3Q68E01 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
INTS3Q68E01 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
INTS3Q68E01 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
INTS3Q68E01 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
INTS3Q68E01 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
INTS3Q68E01 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
INTS3Q68E01 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
INTS3Q68E01 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
INTS3Q68E01 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
INTS3Q68E01 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
INTS3Q68E01 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
INTS3Q68E01 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
INTS3Q68E01 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
INTS3Q68E01 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
INTS3Q68E01 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
INTS3Q68E01 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
INTS3Q68E01 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
INTS3Q68E01 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
INTS3Q68E01 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
INTS3Q68E01 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
INTS3Q68E01 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
INTS3Q68E01 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
INTS3Q68E01 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
INTS3Q68E01 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
INTS3Q68E01 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
INTS3Q68E01 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
INTS3Q68E01 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
INTS3Q68E01 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
INTS3Q68E01 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
INTS3Q68E01 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
INTS3Q68E01 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
INTS3Q68E01 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
INTS3Q68E01 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
INTS3Q68E01 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
INTS3Q68E01 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
INTS3Q68E01 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
INTS3Q68E01 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
INTS3Q68E01 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
INTS3Q68E01 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
INTS3Q68E01 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
INTS3Q68E01 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
INTS3Q68E01 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
INTS3Q68E01 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
INTS3Q68E01 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
INTS3Q68E01 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
INTS3Q68E01 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
INTS3Q68E01 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
INTS3Q68E01 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
INTS3Q68E01 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
INTS3Q68E01 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
INTS3Q68E01 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
INTS3Q68E01 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
INTS3Q68E01 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
INTS3Q68E01 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
INTS3Q68E01 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
INTS3Q68E01 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
INTS3Q68E01 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
INTS3Q68E01 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
INTS3Q68E01 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
INTS3Q68E01 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
INTS3Q68E01 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
INTS3Q68E01 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
INTS3Q68E01 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
INTS3Q68E01 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
INTS3Q68E01 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
INTS3Q68E01 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
INTS3Q68E01 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
INTS3Q68E01 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
INTS3Q68E01 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
INTS3Q68E01 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
INTS3Q68E01 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
INTS3Q68E01 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
INTS3Q68E01 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
INTS3Q68E01 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
INTS3Q68E01 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
INTS3Q68E01 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
INTS3Q68E01 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
INTS3Q68E01 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
INTS3Q68E01 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
INTS3Q68E01 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
INTS3Q68E01 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
INTS3Q68E01 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
INTS3Q68E01 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
INTS3Q68E01 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
INTS3Q68E01 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
INTS3Q68E01 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
INTS3Q68E01 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
INTS3Q68E01 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
INTS3Q68E01 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
INTS3Q68E01 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
INTS3Q68E01 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
INTS3Q68E01 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms