Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ1

RPGRIP1L, Protein fantom, humanhuman

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1LQ68CZ1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
RPGRIP1LQ68CZ1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
RPGRIP1LQ68CZ1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
RPGRIP1LQ68CZ1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
RPGRIP1LQ68CZ1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
RPGRIP1LQ68CZ1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
RPGRIP1LQ68CZ1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
RPGRIP1LQ68CZ1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
RPGRIP1LQ68CZ1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
RPGRIP1LQ68CZ1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
RPGRIP1LQ68CZ1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
RPGRIP1LQ68CZ1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
RPGRIP1LQ68CZ1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC38.07■■■■□ 3.68
RPGRIP1LQ68CZ1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RPGRIP1LQ68CZ1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
RPGRIP1LQ68CZ1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
RPGRIP1LQ68CZ1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
RPGRIP1LQ68CZ1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
RPGRIP1LQ68CZ1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
RPGRIP1LQ68CZ1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
RPGRIP1LQ68CZ1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
RPGRIP1LQ68CZ1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
RPGRIP1LQ68CZ1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
RPGRIP1LQ68CZ1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
RPGRIP1LQ68CZ1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
RPGRIP1LQ68CZ1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
RPGRIP1LQ68CZ1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
RPGRIP1LQ68CZ1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
RPGRIP1LQ68CZ1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
RPGRIP1LQ68CZ1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
RPGRIP1LQ68CZ1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
RPGRIP1LQ68CZ1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
RPGRIP1LQ68CZ1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
RPGRIP1LQ68CZ1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RPGRIP1LQ68CZ1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RPGRIP1LQ68CZ1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RPGRIP1LQ68CZ1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RPGRIP1LQ68CZ1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RPGRIP1LQ68CZ1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RPGRIP1LQ68CZ1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RPGRIP1LQ68CZ1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RPGRIP1LQ68CZ1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
RPGRIP1LQ68CZ1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
RPGRIP1LQ68CZ1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
RPGRIP1LQ68CZ1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RPGRIP1LQ68CZ1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RPGRIP1LQ68CZ1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
RPGRIP1LQ68CZ1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
RPGRIP1LQ68CZ1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
RPGRIP1LQ68CZ1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
RPGRIP1LQ68CZ1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
RPGRIP1LQ68CZ1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
RPGRIP1LQ68CZ1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
RPGRIP1LQ68CZ1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RPGRIP1LQ68CZ1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RPGRIP1LQ68CZ1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RPGRIP1LQ68CZ1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RPGRIP1LQ68CZ1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
RPGRIP1LQ68CZ1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
RPGRIP1LQ68CZ1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
RPGRIP1LQ68CZ1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
RPGRIP1LQ68CZ1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RPGRIP1LQ68CZ1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
RPGRIP1LQ68CZ1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RPGRIP1LQ68CZ1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RPGRIP1LQ68CZ1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RPGRIP1LQ68CZ1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RPGRIP1LQ68CZ1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RPGRIP1LQ68CZ1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RPGRIP1LQ68CZ1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RPGRIP1LQ68CZ1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RPGRIP1LQ68CZ1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RPGRIP1LQ68CZ1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RPGRIP1LQ68CZ1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RPGRIP1LQ68CZ1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RPGRIP1LQ68CZ1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RPGRIP1LQ68CZ1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RPGRIP1LQ68CZ1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RPGRIP1LQ68CZ1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
RPGRIP1LQ68CZ1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
RPGRIP1LQ68CZ1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RPGRIP1LQ68CZ1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RPGRIP1LQ68CZ1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RPGRIP1LQ68CZ1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
RPGRIP1LQ68CZ1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
RPGRIP1LQ68CZ1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
RPGRIP1LQ68CZ1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
RPGRIP1LQ68CZ1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RPGRIP1LQ68CZ1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RPGRIP1LQ68CZ1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RPGRIP1LQ68CZ1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
RPGRIP1LQ68CZ1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
RPGRIP1LQ68CZ1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
RPGRIP1LQ68CZ1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
RPGRIP1LQ68CZ1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RPGRIP1LQ68CZ1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RPGRIP1LQ68CZ1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
RPGRIP1LQ68CZ1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
RPGRIP1LQ68CZ1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
RPGRIP1LQ68CZ1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms