Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGNBP1Q5YKI7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GGNBP1Q5YKI7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGNBP1Q5YKI7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGNBP1Q5YKI7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGNBP1Q5YKI7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GGNBP1Q5YKI7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGNBP1Q5YKI7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGNBP1Q5YKI7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGNBP1Q5YKI7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GGNBP1Q5YKI7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GGNBP1Q5YKI7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GGNBP1Q5YKI7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GGNBP1Q5YKI7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GGNBP1Q5YKI7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GGNBP1Q5YKI7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGNBP1Q5YKI7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGNBP1Q5YKI7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGNBP1Q5YKI7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GGNBP1Q5YKI7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGNBP1Q5YKI7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGNBP1Q5YKI7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGNBP1Q5YKI7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGNBP1Q5YKI7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGNBP1Q5YKI7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGNBP1Q5YKI7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGNBP1Q5YKI7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGNBP1Q5YKI7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGNBP1Q5YKI7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGNBP1Q5YKI7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGNBP1Q5YKI7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGNBP1Q5YKI7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGNBP1Q5YKI7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GGNBP1Q5YKI7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGNBP1Q5YKI7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GGNBP1Q5YKI7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGNBP1Q5YKI7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGNBP1Q5YKI7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGNBP1Q5YKI7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGNBP1Q5YKI7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GGNBP1Q5YKI7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGNBP1Q5YKI7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GGNBP1Q5YKI7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGNBP1Q5YKI7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGNBP1Q5YKI7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGNBP1Q5YKI7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGNBP1Q5YKI7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGNBP1Q5YKI7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGNBP1Q5YKI7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGNBP1Q5YKI7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGNBP1Q5YKI7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GGNBP1Q5YKI7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGNBP1Q5YKI7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGNBP1Q5YKI7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGNBP1Q5YKI7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGNBP1Q5YKI7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGNBP1Q5YKI7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGNBP1Q5YKI7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGNBP1Q5YKI7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGNBP1Q5YKI7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGNBP1Q5YKI7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGNBP1Q5YKI7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGNBP1Q5YKI7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGNBP1Q5YKI7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGNBP1Q5YKI7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GGNBP1Q5YKI7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGNBP1Q5YKI7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GGNBP1Q5YKI7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGNBP1Q5YKI7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGNBP1Q5YKI7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGNBP1Q5YKI7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGNBP1Q5YKI7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGNBP1Q5YKI7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGNBP1Q5YKI7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGNBP1Q5YKI7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGNBP1Q5YKI7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GGNBP1Q5YKI7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGNBP1Q5YKI7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGNBP1Q5YKI7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGNBP1Q5YKI7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGNBP1Q5YKI7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGNBP1Q5YKI7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGNBP1Q5YKI7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGNBP1Q5YKI7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGNBP1Q5YKI7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GGNBP1Q5YKI7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GGNBP1Q5YKI7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GGNBP1Q5YKI7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGNBP1Q5YKI7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms