Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM6

PRAMEF13, Putative PRAME family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF13Q5VWM6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF13Q5VWM6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF13Q5VWM6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF13Q5VWM6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRAMEF13Q5VWM6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF13Q5VWM6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF13Q5VWM6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF13Q5VWM6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF13Q5VWM6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF13Q5VWM6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF13Q5VWM6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF13Q5VWM6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF13Q5VWM6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF13Q5VWM6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF13Q5VWM6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF13Q5VWM6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF13Q5VWM6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF13Q5VWM6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF13Q5VWM6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF13Q5VWM6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF13Q5VWM6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF13Q5VWM6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF13Q5VWM6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF13Q5VWM6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF13Q5VWM6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF13Q5VWM6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF13Q5VWM6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF13Q5VWM6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF13Q5VWM6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF13Q5VWM6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF13Q5VWM6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF13Q5VWM6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF13Q5VWM6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF13Q5VWM6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF13Q5VWM6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF13Q5VWM6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF13Q5VWM6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF13Q5VWM6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF13Q5VWM6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF13Q5VWM6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF13Q5VWM6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF13Q5VWM6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF13Q5VWM6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF13Q5VWM6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF13Q5VWM6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF13Q5VWM6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF13Q5VWM6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF13Q5VWM6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF13Q5VWM6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF13Q5VWM6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF13Q5VWM6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF13Q5VWM6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF13Q5VWM6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF13Q5VWM6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF13Q5VWM6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF13Q5VWM6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF13Q5VWM6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF13Q5VWM6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF13Q5VWM6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF13Q5VWM6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF13Q5VWM6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF13Q5VWM6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF13Q5VWM6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF13Q5VWM6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF13Q5VWM6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF13Q5VWM6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF13Q5VWM6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF13Q5VWM6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF13Q5VWM6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF13Q5VWM6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF13Q5VWM6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF13Q5VWM6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF13Q5VWM6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF13Q5VWM6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF13Q5VWM6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms