Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
LRCH2Q5VUJ6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRCH2Q5VUJ6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRCH2Q5VUJ6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRCH2Q5VUJ6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
LRCH2Q5VUJ6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRCH2Q5VUJ6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRCH2Q5VUJ6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRCH2Q5VUJ6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRCH2Q5VUJ6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRCH2Q5VUJ6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
LRCH2Q5VUJ6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRCH2Q5VUJ6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRCH2Q5VUJ6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRCH2Q5VUJ6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRCH2Q5VUJ6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRCH2Q5VUJ6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRCH2Q5VUJ6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRCH2Q5VUJ6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRCH2Q5VUJ6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRCH2Q5VUJ6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRCH2Q5VUJ6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRCH2Q5VUJ6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRCH2Q5VUJ6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRCH2Q5VUJ6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRCH2Q5VUJ6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRCH2Q5VUJ6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRCH2Q5VUJ6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRCH2Q5VUJ6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRCH2Q5VUJ6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRCH2Q5VUJ6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRCH2Q5VUJ6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRCH2Q5VUJ6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRCH2Q5VUJ6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRCH2Q5VUJ6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRCH2Q5VUJ6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRCH2Q5VUJ6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRCH2Q5VUJ6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRCH2Q5VUJ6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRCH2Q5VUJ6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRCH2Q5VUJ6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRCH2Q5VUJ6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRCH2Q5VUJ6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
LRCH2Q5VUJ6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRCH2Q5VUJ6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
LRCH2Q5VUJ6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRCH2Q5VUJ6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRCH2Q5VUJ6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRCH2Q5VUJ6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
LRCH2Q5VUJ6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LRCH2Q5VUJ6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRCH2Q5VUJ6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRCH2Q5VUJ6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRCH2Q5VUJ6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRCH2Q5VUJ6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRCH2Q5VUJ6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRCH2Q5VUJ6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRCH2Q5VUJ6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRCH2Q5VUJ6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRCH2Q5VUJ6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRCH2Q5VUJ6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRCH2Q5VUJ6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRCH2Q5VUJ6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRCH2Q5VUJ6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRCH2Q5VUJ6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRCH2Q5VUJ6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRCH2Q5VUJ6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRCH2Q5VUJ6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRCH2Q5VUJ6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRCH2Q5VUJ6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRCH2Q5VUJ6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRCH2Q5VUJ6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRCH2Q5VUJ6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRCH2Q5VUJ6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRCH2Q5VUJ6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRCH2Q5VUJ6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRCH2Q5VUJ6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRCH2Q5VUJ6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRCH2Q5VUJ6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRCH2Q5VUJ6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRCH2Q5VUJ6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRCH2Q5VUJ6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRCH2Q5VUJ6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
LRCH2Q5VUJ6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRCH2Q5VUJ6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRCH2Q5VUJ6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRCH2Q5VUJ6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRCH2Q5VUJ6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRCH2Q5VUJ6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LRCH2Q5VUJ6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRCH2Q5VUJ6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRCH2Q5VUJ6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRCH2Q5VUJ6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRCH2Q5VUJ6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRCH2Q5VUJ6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRCH2Q5VUJ6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRCH2Q5VUJ6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRCH2Q5VUJ6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRCH2Q5VUJ6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRCH2Q5VUJ6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms