Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC7Q5VTL7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC7Q5VTL7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC7Q5VTL7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC7Q5VTL7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC7Q5VTL7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC7Q5VTL7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC7Q5VTL7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC7Q5VTL7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC7Q5VTL7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC7Q5VTL7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC7Q5VTL7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC7Q5VTL7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC7Q5VTL7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC7Q5VTL7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC7Q5VTL7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC7Q5VTL7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC7Q5VTL7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC7Q5VTL7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC7Q5VTL7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC7Q5VTL7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC7Q5VTL7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC7Q5VTL7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC7Q5VTL7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC7Q5VTL7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNDC7Q5VTL7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC7Q5VTL7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC7Q5VTL7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC7Q5VTL7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC7Q5VTL7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNDC7Q5VTL7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC7Q5VTL7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNDC7Q5VTL7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC7Q5VTL7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC7Q5VTL7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC7Q5VTL7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FNDC7Q5VTL7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNDC7Q5VTL7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FNDC7Q5VTL7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC7Q5VTL7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC7Q5VTL7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC7Q5VTL7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC7Q5VTL7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC7Q5VTL7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC7Q5VTL7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC7Q5VTL7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC7Q5VTL7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC7Q5VTL7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC7Q5VTL7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC7Q5VTL7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC7Q5VTL7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC7Q5VTL7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC7Q5VTL7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC7Q5VTL7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC7Q5VTL7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC7Q5VTL7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC7Q5VTL7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC7Q5VTL7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC7Q5VTL7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
FNDC7Q5VTL7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC7Q5VTL7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC7Q5VTL7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC7Q5VTL7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC7Q5VTL7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC7Q5VTL7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC7Q5VTL7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC7Q5VTL7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC7Q5VTL7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC7Q5VTL7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC7Q5VTL7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC7Q5VTL7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC7Q5VTL7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms