Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT6Q5T7P8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYT6Q5T7P8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT6Q5T7P8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT6Q5T7P8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT6Q5T7P8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYT6Q5T7P8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYT6Q5T7P8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYT6Q5T7P8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT6Q5T7P8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYT6Q5T7P8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT6Q5T7P8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT6Q5T7P8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYT6Q5T7P8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT6Q5T7P8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT6Q5T7P8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT6Q5T7P8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYT6Q5T7P8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYT6Q5T7P8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT6Q5T7P8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYT6Q5T7P8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYT6Q5T7P8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT6Q5T7P8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT6Q5T7P8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYT6Q5T7P8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT6Q5T7P8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT6Q5T7P8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT6Q5T7P8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT6Q5T7P8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT6Q5T7P8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT6Q5T7P8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT6Q5T7P8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT6Q5T7P8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT6Q5T7P8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT6Q5T7P8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT6Q5T7P8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT6Q5T7P8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYT6Q5T7P8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYT6Q5T7P8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT6Q5T7P8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT6Q5T7P8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT6Q5T7P8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT6Q5T7P8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT6Q5T7P8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT6Q5T7P8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT6Q5T7P8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT6Q5T7P8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT6Q5T7P8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT6Q5T7P8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT6Q5T7P8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT6Q5T7P8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT6Q5T7P8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT6Q5T7P8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT6Q5T7P8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT6Q5T7P8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT6Q5T7P8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT6Q5T7P8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT6Q5T7P8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT6Q5T7P8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT6Q5T7P8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT6Q5T7P8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT6Q5T7P8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT6Q5T7P8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT6Q5T7P8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT6Q5T7P8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT6Q5T7P8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT6Q5T7P8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT6Q5T7P8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT6Q5T7P8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT6Q5T7P8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT6Q5T7P8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT6Q5T7P8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT6Q5T7P8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT6Q5T7P8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT6Q5T7P8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT6Q5T7P8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT6Q5T7P8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT6Q5T7P8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT6Q5T7P8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT6Q5T7P8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT6Q5T7P8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT6Q5T7P8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYT6Q5T7P8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT6Q5T7P8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT6Q5T7P8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT6Q5T7P8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT6Q5T7P8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT6Q5T7P8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT6Q5T7P8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT6Q5T7P8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT6Q5T7P8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYT6Q5T7P8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT6Q5T7P8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms