Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P3

LCE1B, Late cornified envelope protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCE1BQ5T7P3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LCE1BQ5T7P3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LCE1BQ5T7P3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LCE1BQ5T7P3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LCE1BQ5T7P3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LCE1BQ5T7P3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
LCE1BQ5T7P3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
LCE1BQ5T7P3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
LCE1BQ5T7P3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
LCE1BQ5T7P3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
LCE1BQ5T7P3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
LCE1BQ5T7P3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
LCE1BQ5T7P3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
LCE1BQ5T7P3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
LCE1BQ5T7P3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
LCE1BQ5T7P3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
LCE1BQ5T7P3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
LCE1BQ5T7P3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
LCE1BQ5T7P3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
LCE1BQ5T7P3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
LCE1BQ5T7P3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
LCE1BQ5T7P3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
LCE1BQ5T7P3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
LCE1BQ5T7P3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
LCE1BQ5T7P3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
LCE1BQ5T7P3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
LCE1BQ5T7P3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
LCE1BQ5T7P3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms